More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2453 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2453  type II secretion system protein E  100 
 
 
396 aa  809    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0722  type II secretion system protein E  51.71 
 
 
385 aa  348  8e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  35.63 
 
 
474 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.89 
 
 
472 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  31.16 
 
 
521 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  31.16 
 
 
523 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  32.09 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  32.09 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  31.16 
 
 
523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  32.09 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  32.09 
 
 
515 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  33.24 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  34.43 
 
 
472 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  34.13 
 
 
472 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.33 
 
 
441 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  32.71 
 
 
477 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.04 
 
 
444 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
463 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  32.23 
 
 
432 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
480 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  34.06 
 
 
491 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  30.63 
 
 
624 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  34.06 
 
 
491 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  29.74 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  30.84 
 
 
442 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  32.83 
 
 
451 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  33.23 
 
 
482 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  33.03 
 
 
485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  33.79 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  30.11 
 
 
463 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
488 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  34.06 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.06 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  31.49 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  32.42 
 
 
488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
465 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
485 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  32.73 
 
 
483 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  32.34 
 
 
463 aa  162  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  32.73 
 
 
484 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  29.09 
 
 
467 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  31.82 
 
 
482 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  32.62 
 
 
492 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
482 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
462 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
482 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.74 
 
 
572 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  32.19 
 
 
508 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
465 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  34.62 
 
 
455 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.62 
 
 
455 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  31.38 
 
 
469 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  33.97 
 
 
455 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  29.25 
 
 
450 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  34.62 
 
 
455 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  34.62 
 
 
455 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
500 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
467 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
452 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  31.52 
 
 
490 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
454 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  32.13 
 
 
467 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  31.27 
 
 
569 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
454 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
454 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
455 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  32.5 
 
 
433 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
473 aa  159  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  31.74 
 
 
589 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  34.6 
 
 
459 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  30.42 
 
 
491 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.2 
 
 
453 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  29.74 
 
 
440 aa  159  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.51 
 
 
476 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
455 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  31.9 
 
 
563 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  30 
 
 
481 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.74 
 
 
634 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  31.18 
 
 
487 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  33.97 
 
 
454 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  33.03 
 
 
638 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  34.6 
 
 
456 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
449 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  30.86 
 
 
408 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  31.65 
 
 
594 aa  157  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.74 
 
 
452 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  30.91 
 
 
489 aa  156  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
504 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5621  type II secretion system protein E  33.13 
 
 
632 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  29.97 
 
 
412 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  32.82 
 
 
632 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  31.8 
 
 
445 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  31.07 
 
 
411 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  34.63 
 
 
472 aa  155  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  32.7 
 
 
454 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  31.16 
 
 
482 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  36.06 
 
 
677 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  35.4 
 
 
742 aa  153  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>