72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0199 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  57.07 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  57.07 
 
 		 204 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  56.37 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  55.33 
 
 		 204 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  41.82 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  41.26 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  40.2 
 
 		 181 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  40.93 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  39.34 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  39.34 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  39.9 
 
 		 181 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  40.93 
 
 		 177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  42.99 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  44.32 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  46.24 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  36.02 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  36.02 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  34.09 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  34.36 
 
 		 335 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  37.09 
 
 		 203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  35.48 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  35.24 
 
 		 181 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  36.68 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  37.16 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  36.79 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  39.11 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  35.44 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  39.04 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  35.07 
 
 		 182 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  33.68 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  30.13 
 
 		 875 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  33.71 
 
 		 253 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  33.91 
 
 		 269 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  34.03 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  33.51 
 
 		 789 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  34.44 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  47.56 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  47.56 
 
 		 95 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  33.14 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  34.17 
 
 		 674 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  27.49 
 
 		 743 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  30.69 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  35.62 
 
 		 1297 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  30.73 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  37 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 1054 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  38.37 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  35.81 
 
 		 787 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  38.05 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  24.66 
 
 		 776 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0261  hypothetical protein  48.15 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  25.84 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  33.73 
 
 		 384 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  26.15 
 
 		 964 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  35.94 
 
 		 311 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  33.73 
 
 		 367 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  41.07 
 
 		 989 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  45.45 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0738  M23 peptidase domain-containing protein  24.66 
 
 		 765 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0168  M23 peptidase domain-containing protein  25.56 
 
 		 765 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.730515  hitchhiker  0.0000407219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0806  peptidase M23B  25.56 
 
 		 765 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  27.75 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  29.71 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  26.6 
 
 		 359 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  29.71 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  29.71 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>