More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001244 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  84.04 
 
 		 376 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 		 376 aa  767    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  83.24 
 
 		 376 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  69.68 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  50.66 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  51.72 
 
 		 378 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  50.4 
 
 		 381 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  51.19 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  51.19 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  51.19 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  50.4 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  50.92 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  50.13 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  49.07 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  50.13 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  48.31 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  47.83 
 
 		 378 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  46.56 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  46.56 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  46.3 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  45.5 
 
 		 378 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  46.3 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  46.3 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  46.3 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  46.3 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  46.3 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  46.3 
 
 		 378 aa  342  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  50.4 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  46.03 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  44.47 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  44.47 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  44.47 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  44.47 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  44.47 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  44.47 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  44.47 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  44.47 
 
 		 378 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  43.95 
 
 		 378 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3029  hypothetical protein  43.54 
 
 		 382 aa  318  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  41.8 
 
 		 378 aa  298  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  41.95 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  34.59 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  30.67 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1216  secretion protein HlyD family protein  30.46 
 
 		 383 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0651482  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  31.27 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  28.43 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0854  secretion protein, HlyD family  28.94 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2397  secretion protein HlyD family protein  34.78 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  decreased coverage  0.00226725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  27.6 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1904  secretion protein, HlyD family  28.44 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382262  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  31.2 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3992  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0185  putative multidrug resistance efflux pump  27.91 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  32.84 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2821  secretion protein HlyD family protein  26.61 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  26.73 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  30.67 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  28.15 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  26.25 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2743  secretion protein HlyD family protein  26.26 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5668  secretion protein HlyD family protein  34.78 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  30.45 
 
 		 368 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1552  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  31.95 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  31.95 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  31.95 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  31.95 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  31.95 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  31.95 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  31.95 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0942  putative secretion protein, HlyD family  26.27 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2138  secretion protein HlyD  26.24 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3421  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02789  putative efflux pump protein  25.84 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  31.54 
 
 		 343 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0205  putative multidrug resistance efflux pump  26.7 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  25.8 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1965  putative membrane fusion protein family member  28.46 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.686459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  26.17 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2912  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0618  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  32.16 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3609  secretion protein HlyD family protein  27.71 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  24.5 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  28.03 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  27.54 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3771  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0541  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  29.18 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  32.64 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0570  secretion protein HlyD family protein  27.7 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  31.03 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  27.68 
 
 		 331 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3434  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0517  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0565  secretion protein HlyD family protein  27.57 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>