97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000745 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  100 
 
 
172 aa  357  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  94.19 
 
 
172 aa  342  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  73.84 
 
 
172 aa  278  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  69.19 
 
 
173 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  66.28 
 
 
205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  65.91 
 
 
180 aa  245  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  61.63 
 
 
186 aa  243  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  63.37 
 
 
176 aa  240  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  63.37 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  61.02 
 
 
177 aa  220  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  57.39 
 
 
187 aa  217  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
178 aa  217  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  59.32 
 
 
180 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  59.32 
 
 
180 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  59.32 
 
 
176 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  59.32 
 
 
176 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 
182 aa  210  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  59.32 
 
 
176 aa  210  9e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 
176 aa  203  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 
176 aa  203  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  56.5 
 
 
176 aa  201  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 
177 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 
175 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  33.55 
 
 
171 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  32.9 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
145 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
145 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
282 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  42.03 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
314 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  27.56 
 
 
231 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  48.78 
 
 
325 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
341 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  27.15 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
322 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  47.62 
 
 
314 aa  45.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  31.13 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  44.7  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  41.67 
 
 
292 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  33.66 
 
 
145 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  46 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  23.13 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
351 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  37.36 
 
 
229 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
237 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
303 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  30 
 
 
340 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
315 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
157 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  35.29 
 
 
181 aa  42  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
303 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
190 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  44 
 
 
356 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
175 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.8 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 
137 aa  41.2  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
216 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 
241 aa  41.2  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0198  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  31.5 
 
 
1407 aa  41.2  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.329486  normal  0.063927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  37.93 
 
 
336 aa  41.2  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
255 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  32.28 
 
 
1407 aa  40.8  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  43.59 
 
 
317 aa  40.8  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
157 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
149 aa  40.8  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
302 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>