250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1636 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 109 aa  215  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  38.3 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  53.19 
 
 		 262 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  53.19 
 
 		 262 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  53.19 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3244  glycoside hydrolase family 25  61.36 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0027526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  57.45 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  36.73 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  38.96 
 
 		 286 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  52.27 
 
 		 424 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  28.97 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  43.75 
 
 		 274 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  46.81 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  38.6 
 
 		 499 aa  52  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  51.79 
 
 		 341 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  59.52 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  47.06 
 
 		 372 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 337 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44.23 
 
 		 293 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  47.06 
 
 		 372 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  47.06 
 
 		 293 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  53.06 
 
 		 642 aa  50.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.06 
 
 		 1001 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  48.84 
 
 		 429 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.62 
 
 		 448 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  44 
 
 		 526 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.11 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 754 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  42.22 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 1021 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  45.28 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  42.22 
 
 		 445 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  42.86 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  47.92 
 
 		 1556 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 590 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1756  peptidase M23B  46.51 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657093  decreased coverage  0.0000000551494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  41.51 
 
 		 727 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  41.51 
 
 		 727 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  42.31 
 
 		 331 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44.83 
 
 		 470 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  40.38 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0082  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 567 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.86 
 
 		 954 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.67 
 
 		 288 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.5 
 
 		 543 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  40.82 
 
 		 323 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  42.22 
 
 		 788 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 191 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  35.53 
 
 		 297 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  44.44 
 
 		 353 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  51.11 
 
 		 187 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65030  hypothetical protein  38.46 
 
 		 231 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.195389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 1079 aa  47  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_002620  TC0890  hypothetical protein  41.03 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.874622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  45.1 
 
 		 288 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  56.1 
 
 		 444 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  45.24 
 
 		 402 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  36.71 
 
 		 285 aa  46.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  42.86 
 
 		 430 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  46.67 
 
 		 417 aa  46.6  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  52.08 
 
 		 338 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.55 
 
 		 568 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  46.67 
 
 		 390 aa  46.2  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.17 
 
 		 391 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 382 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  30.86 
 
 		 503 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 314 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 307 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  42.11 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0180  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 567 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 327 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  40 
 
 		 394 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  43.59 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  47.73 
 
 		 301 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  44.19 
 
 		 299 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.45 
 
 		 382 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  41.18 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.5 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  31.11 
 
 		 261 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  42 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  42.86 
 
 		 330 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  38.81 
 
 		 303 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1435  Peptidase M23  38.6 
 
 		 265 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0922892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 555 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  48.89 
 
 		 442 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1007  LysM domain-containing protein  51.22 
 
 		 504 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  36 
 
 		 212 aa  44.7  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  33.7 
 
 		 298 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  44.19 
 
 		 292 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  33.7 
 
 		 298 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  53.49 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  41.3 
 
 		 520 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  53.49 
 
 		 250 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>