More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1422 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 159 aa  317  5e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  92.45 
 
 		 159 aa  283  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  93.08 
 
 		 159 aa  283  8e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  91.19 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  63.06 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  59.62 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  46.79 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  45.96 
 
 		 185 aa  120  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  49.04 
 
 		 180 aa  117  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  42.41 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  42.24 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  41.77 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  41.77 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  45.28 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  40.51 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  41.14 
 
 		 178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  42.77 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  40.99 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  43.75 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  44.08 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 201 aa  104  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  43.15 
 
 		 216 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  39.86 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  41.83 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  42.65 
 
 		 193 aa  99.8  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  40.37 
 
 		 182 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  42.65 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  42.65 
 
 		 189 aa  95.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.78 
 
 		 194 aa  94.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  39.58 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  36.08 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  36.11 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  58.7 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  40.48 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  62.22 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  60 
 
 		 208 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  56.52 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  50.88 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  49.12 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  49.12 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  48.15 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  49.12 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  55.81 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  55.81 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  34.48 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  35.16 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  52.27 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  52.17 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  47.92 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  45.28 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  25.87 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  56.52 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0915  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  26.06 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.89 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  48.89 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  51.16 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  39.34 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  38.46 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  46 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>