More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1203 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  57.58 
 
 		 193 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  42.38 
 
 		 176 aa  104  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 560 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  45.52 
 
 		 471 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.98 
 
 		 356 aa  92.8  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.84 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  37.91 
 
 		 252 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  41.27 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1340  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  40.85 
 
 		 535 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  46.36 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  41.88 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  43.9 
 
 		 477 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  47.32 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 366 aa  78.6  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  38.4 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2434  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 507 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.1 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0659  outer membrane protein, OmpA family  41.67 
 
 		 307 aa  74.7  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  38.76 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.47 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.83 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.8 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  38.79 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  37.84 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  37.84 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.22 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 375 aa  72  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.59 
 
 		 351 aa  71.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  40.68 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.2 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 376 aa  71.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.67 
 
 		 478 aa  71.2  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.74 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.15 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 1755 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0186  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  40.65 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  35.25 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  39.52 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.91 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  38.84 
 
 		 481 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  41.67 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  41.67 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.89 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.89 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.89 
 
 		 344 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  32.32 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.63 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  33.33 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  36.22 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  41.07 
 
 		 344 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0842  outer membrane protein  35.9 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0308404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.39 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  38.89 
 
 		 345 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 322 aa  67.8  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.35 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4096  OmpA/MotB domain protein  41.56 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287994  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.53 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 		 638 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 		 224 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.9 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  33.04 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.72 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  34.16 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  34.22 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.4 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.6 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  34.65 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.03 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 623 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>