More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0186 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0186  OmpA/MotB  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0698  OmpA/MotB  46.56 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.06 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  52.24 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2026  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  45.12 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2021  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor (19 kDa surface antigen) (PPL)  45.12 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0187  putative lipoprotein  38.27 
 
 		 101 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.27 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  36.54 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  35.34 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.1 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  35.34 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  35.34 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.45 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  42.17 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  34.34 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  35.14 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  52.24 
 
 		 402 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  35.14 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  37.5 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  35 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  34.11 
 
 		 374 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  29.58 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  37.5 
 
 		 321 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.82 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  36.54 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.51 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 638 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  35.51 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1899  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  34.69 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.640623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.25 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.71 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  34.59 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.39 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  34.06 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0563  OmpA/MotB domain-containing protein  29.77 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.58 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  31.65 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  43.84 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  28.76 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.39 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.16 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  33.81 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 		 502 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0664  OmpA family protein  30.84 
 
 		 422 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.58 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  32.38 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0293  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  42.47 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.25 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  32.08 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  30.61 
 
 		 294 aa  54.7  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.61 
 
 		 478 aa  54.7  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  32.26 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  33.98 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  32.81 
 
 		 348 aa  54.3  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>