More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0664 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0664  OmpA family protein  100 
 
 
422 aa  866    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0166  outer membrane protein  29.44 
 
 
381 aa  183  6e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000251443  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  27.19 
 
 
403 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1992  OmpA family protein  24.89 
 
 
452 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.88 
 
 
296 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40.56 
 
 
225 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.13 
 
 
641 aa  82.8  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 
525 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  34.31 
 
 
264 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  32.37 
 
 
218 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  35.77 
 
 
223 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2148  OmpA family protein  41.12 
 
 
449 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  35.9 
 
 
365 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
223 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  31.45 
 
 
640 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  30.36 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  33.86 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.73 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  40.35 
 
 
631 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  31.15 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  33.07 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  35.33 
 
 
919 aa  74.3  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  33.61 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  38.56 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  29.71 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 
704 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  36.88 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  36.23 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.44 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.44 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.82 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  25.49 
 
 
510 aa  73.2  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  42.05 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
1026 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  39.66 
 
 
222 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 
727 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 
333 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  39.42 
 
 
326 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  38.05 
 
 
222 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  34.29 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  32.86 
 
 
286 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 
228 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  33.94 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.4 
 
 
694 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.5 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 
262 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.08 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.2 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  31.93 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  31.91 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  34.26 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.7 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  30.97 
 
 
673 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  32.62 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.08 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
270 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
454 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.04 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 
270 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
231 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  33.9 
 
 
311 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.68 
 
 
221 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.38 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  39.84 
 
 
251 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 
490 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  32.62 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  32.48 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  36.54 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  32.41 
 
 
228 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 
218 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.65 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 
228 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.76 
 
 
537 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  31.47 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  32.48 
 
 
261 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  32.39 
 
 
166 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  32.28 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>