More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1105 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 443 aa  887    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  63 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  36.93 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.32 
 
 		 430 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.37 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 424 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  31.47 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.74 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 488 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.98 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.79 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.56 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 459 aa  103  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.68 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 		 466 aa  99.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  29.28 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.06 
 
 		 437 aa  97.1  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 437 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.06 
 
 		 437 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 415 aa  96.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 423 aa  96.7  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.27 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.02 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 479 aa  93.2  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 454 aa  93.2  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 412 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 411 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.21 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 447 aa  90.9  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 430 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 486 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.45 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.68 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 442 aa  86.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.42 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.4 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.61 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.47 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.21 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>