More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1040 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 372 aa  758    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  60.66 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  54.37 
 
 		 347 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  55.52 
 
 		 360 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  56.6 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  60.55 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  56.84 
 
 		 443 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  72.35 
 
 		 212 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  41.46 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  41.32 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  53.6 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  40 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  54.63 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  42.67 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  43.22 
 
 		 378 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  41.95 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  41.95 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  31.58 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  38.77 
 
 		 391 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  29.57 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  56.57 
 
 		 456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  57.58 
 
 		 422 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  31.14 
 
 		 351 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  30.47 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  52.04 
 
 		 451 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  55.56 
 
 		 474 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  33.48 
 
 		 402 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  51.04 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  32.61 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  33.05 
 
 		 222 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  34.88 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  57.45 
 
 		 593 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  52.81 
 
 		 913 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  47.47 
 
 		 847 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 658 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  50 
 
 		 447 aa  96.3  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  31.25 
 
 		 201 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50.59 
 
 		 448 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  48.94 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 408 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  31.74 
 
 		 408 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  31.88 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  31.88 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 417 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  31.74 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  33.76 
 
 		 497 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  45.63 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 449 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  52.13 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  48.78 
 
 		 773 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  48.35 
 
 		 673 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  30.47 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  45.95 
 
 		 702 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.15 
 
 		 437 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  31.44 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  41.6 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  40 
 
 		 486 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  48.35 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  43.37 
 
 		 925 aa  86.7  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  31.49 
 
 		 223 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  48 
 
 		 453 aa  85.9  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  26.46 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  43.48 
 
 		 681 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  36.73 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  44.44 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.32 
 
 		 846 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  44.07 
 
 		 978 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  43.88 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  41.48 
 
 		 756 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  41.84 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  42.39 
 
 		 906 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  45.24 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  26.52 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  31.8 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.68 
 
 		 609 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  43.9 
 
 		 842 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 1209 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  37.23 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  54.64 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 		 854 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  46.43 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  45.36 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  44.9 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  44 
 
 		 763 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  45.36 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  38.94 
 
 		 942 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  32.87 
 
 		 792 aa  76.3  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 534 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 562 aa  76.3  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 534 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 534 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  44.68 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 1128 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  47.83 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  51.14 
 
 		 89 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  40.23 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>