More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  56.61 
 
 		 192 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  84.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.34 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  31.82 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  27.83 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  27.97 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>