More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3308 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3308  ROK family protein  100 
 
 		 404 aa  792    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.715302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3099  ROK family protein  42.12 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1023  ROK family protein  43.29 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164512  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1190  ROK family protein  34 
 
 		 418 aa  212  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.0524506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  35.2 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  30.18 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  29.18 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  30.54 
 
 		 395 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  30.61 
 
 		 385 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.27 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.25 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.19 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.25 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  30.99 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.4 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  22.66 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  29.9 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.76 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  23.37 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  23.81 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.38 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  29.32 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  30.18 
 
 		 404 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  29.38 
 
 		 425 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  27.76 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  31.85 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  22.11 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  30.05 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  23.84 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  28.03 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.97 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.8 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.44 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  31.35 
 
 		 312 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.2 
 
 		 405 aa  96.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  21.41 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  22.67 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.15 
 
 		 418 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.04 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  29.55 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  23.48 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  30.46 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
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NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  31.46 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  31.13 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  29.22 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.86 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.14 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  29.58 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  26.68 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  33.22 
 
 		 321 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  22.76 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  33.67 
 
 		 303 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.14 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  30.81 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  23.54 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  30 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.7 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  26.47 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  30.81 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  32.28 
 
 		 448 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  30.39 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  20.87 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  24.39 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  29.19 
 
 		 413 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  31.34 
 
 		 304 aa  90.5  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  29.55 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.71 
 
 		 403 aa  90.1  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  36.92 
 
 		 457 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.82 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0957  ROK family protein  24.68 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.7 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  28.57 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  24.16 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.96 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  23.64 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  31.49 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  24.83 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  28.35 
 
 		 336 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  25.75 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  26.05 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  29.5 
 
 		 307 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  27 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  29.78 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  30.03 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.92 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  25.66 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  30.99 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  29.05 
 
 		 320 aa  86.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  26.85 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  37.02 
 
 		 836 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.13 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  28.38 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  23.96 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.7 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
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NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  29.5 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
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NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  33.56 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.27 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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