More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0737 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 355 aa  705    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  60.18 
 
 		 349 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  60.18 
 
 		 349 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  59.64 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  57.43 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  52.91 
 
 		 377 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  52.96 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  52.66 
 
 		 387 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  52.74 
 
 		 380 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  52.05 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  51.17 
 
 		 348 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  53.8 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  50.58 
 
 		 385 aa  316  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  47.98 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  52.62 
 
 		 377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  48.18 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  53.85 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  50.6 
 
 		 397 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  45.29 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  44.71 
 
 		 463 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  51.79 
 
 		 358 aa  282  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  43.35 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  43.28 
 
 		 444 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  40.81 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  43.85 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  42.57 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  39.49 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  41.75 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  42.56 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  40.22 
 
 		 351 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  41.19 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  40.9 
 
 		 351 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  40.57 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.91 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.62 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.61 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 		 390 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.32 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.69 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.21 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 383 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 382 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  38.24 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  39.81 
 
 		 378 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  35.61 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  40.6 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  37.58 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 372 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  40.51 
 
 		 385 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  35.9 
 
 		 347 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.69 
 
 		 352 aa  192  7e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.73 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  42.31 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  40.35 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  40.26 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  43.65 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  37.16 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  38.69 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  36.13 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  39.35 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  38.19 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  41.18 
 
 		 367 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  40.66 
 
 		 353 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 404 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  40.37 
 
 		 360 aa  185  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  40.31 
 
 		 397 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  38.76 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  38.76 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 371 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  40.55 
 
 		 390 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  37.1 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  37.35 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  35.83 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  38.11 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  38.56 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  32.92 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.73 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  37.35 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  37.05 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  37.79 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  39.94 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.97 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  37.25 
 
 		 394 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  37.74 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>