294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4111 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4111  Rhs family protein-like protein  100 
 
 		 989 aa  2046    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  0.0101653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  27.99 
 
 		 1401 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1368 aa  277  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26 
 
 		 1485 aa  220  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.27 
 
 		 1259 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1197 aa  206  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1550 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25 
 
 		 1586 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1547 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1527 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1520 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.98 
 
 		 1595 aa  184  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1488 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.18 
 
 		 1509 aa  181  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1551 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  23.31 
 
 		 1508 aa  175  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1611 aa  171  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.75 
 
 		 1639 aa  171  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  25.63 
 
 		 1673 aa  170  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25.44 
 
 		 1679 aa  167  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  23.48 
 
 		 1528 aa  167  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  22.81 
 
 		 1576 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  22.84 
 
 		 1528 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  23.64 
 
 		 1421 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.88 
 
 		 1572 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.26 
 
 		 1560 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  23.55 
 
 		 1495 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.72 
 
 		 1434 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.39 
 
 		 1384 aa  155  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.18 
 
 		 1489 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.12 
 
 		 1614 aa  154  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  25.4 
 
 		 1429 aa  154  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.7 
 
 		 1517 aa  153  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.64 
 
 		 1981 aa  149  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1487 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  24.33 
 
 		 2144 aa  145  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.32 
 
 		 1446 aa  145  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.16 
 
 		 1494 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1494 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  23.14 
 
 		 1422 aa  144  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  27.15 
 
 		 1579 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.15 
 
 		 1428 aa  142  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1565 aa  142  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1565 aa  142  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  23.48 
 
 		 1568 aa  141  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  22.92 
 
 		 1447 aa  141  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1418 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  24.39 
 
 		 1359 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  22.97 
 
 		 1390 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  21.54 
 
 		 1189 aa  137  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  23.43 
 
 		 1437 aa  137  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1959 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 1402 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1527 aa  136  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  22.69 
 
 		 1428 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 934 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.3 
 
 		 1518 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  22.17 
 
 		 1539 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  22.46 
 
 		 1539 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1917 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  22.11 
 
 		 1466 aa  132  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.3 
 
 		 1942 aa  132  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1699 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.87 
 
 		 1609 aa  131  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1409 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1586 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1600 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1541 aa  128  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1381 aa  128  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1541 aa  128  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1541 aa  128  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.01 
 
 		 2096 aa  127  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  21.96 
 
 		 1543 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.07 
 
 		 1840 aa  126  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  22.86 
 
 		 1541 aa  126  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1541 aa  126  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1541 aa  125  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.96 
 
 		 1626 aa  125  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  21.86 
 
 		 1552 aa  125  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  19.43 
 
 		 2035 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  24.18 
 
 		 1573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.32 
 
 		 2149 aa  121  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.21 
 
 		 1669 aa  121  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  22.95 
 
 		 1475 aa  121  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.92 
 
 		 924 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1410 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  22.55 
 
 		 1423 aa  120  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  22.56 
 
 		 1457 aa  120  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1620 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  21.71 
 
 		 1271 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.91 
 
 		 1362 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.24 
 
 		 1348 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  22.3 
 
 		 2277 aa  118  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 1386 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  22.39 
 
 		 1530 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  22.82 
 
 		 1140 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  21.24 
 
 		 1150 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1229 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  21.24 
 
 		 1150 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  21.64 
 
 		 1492 aa  115  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>