233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0540 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  64.49 
 
 		 278 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  47.21 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  35.21 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  35.45 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  40 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  39.59 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  36.24 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  38.46 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.03 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  32.92 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  35.03 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  37.63 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  29.76 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  34.27 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  35.53 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  30.65 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  30.92 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2320  fatty acid hydroxylase  35.68 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  36.41 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  38.42 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  38.42 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  32.09 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  36.04 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  29.34 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  35.53 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.73 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  37.89 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  36.76 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  30.8 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.57 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  33.7 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0827  fatty acid hydroxylase  35.07 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.24 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  30.92 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  33.33 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  33.16 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3434  fatty acid hydroxylase  29.73 
 
 		 289 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000865643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  31.44 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  36.69 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  37.01 
 
 		 337 aa  92  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  29.41 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  28.43 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  30.63 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  28.08 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5174  fatty acid hydroxylase  31.64 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  30.22 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  29.02 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  30.98 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3695  fatty acid hydroxylase  28.41 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00011612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  24.8 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  27.72 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.49 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  30.6 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  29.44 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.46 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  31.46 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.46 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  31.55 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  34.05 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  30.41 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  24.49 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3133  fatty acid hydroxylase  30.99 
 
 		 407 aa  68.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3145  hypothetical protein  27.95 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  32.49 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  32.53 
 
 		 407 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  28.78 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  29.79 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  29.79 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  28.78 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  28.78 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  29.79 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  31.1 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  29.58 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2332  hypothetical protein  28.93 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  31.17 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  27.19 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0281  fatty acid hydroxylase  30.29 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  29.09 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  32.65 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.23 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11844  membrane-bound C-5 sterol desaturase erg3 (sterol-c5-desaturase)  30.06 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  30.2 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  31.08 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  28.67 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3418  sterol desaturase-related protein  32 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0225552  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  30.21 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  32.61 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  30.71 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  30.2 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  27.52 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  27.97 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  32.48 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  28.81 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  30.41 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  30.41 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>