256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  100 
 
 		 306 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  50.64 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  47.62 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  37.94 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  38.06 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  46.25 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  45.72 
 
 		 309 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  42.21 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  43.32 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  45.18 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  43.79 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  43.51 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  42.77 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  42.95 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  37.5 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  48.06 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  44.09 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  41.04 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  38.4 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  36.13 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  36.36 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  32.68 
 
 		 347 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  33 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.53 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.7 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.24 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  32.64 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  32.34 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.39 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.1 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.14 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  31.53 
 
 		 372 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  30.14 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  30.82 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  31.16 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  31.86 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  31.86 
 
 		 309 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  31.4 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.18 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  32.88 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.31 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  31.16 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  31 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.55 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.11 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.94 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  31.19 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.31 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  28.05 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  30.93 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.93 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.94 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.94 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.02 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.02 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.06 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.23 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  27.91 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.38 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.38 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.38 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.61 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.9 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0694  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  25.34 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  31.71 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>