More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2042 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  68.38 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  67.41 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  66.42 
 
 		 139 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  62.12 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  62.12 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  55.3 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  54.55 
 
 		 138 aa  150  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  50.76 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  53.03 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1347  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 142 aa  84.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186903  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  25 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 172 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  30.95 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  45.45 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  28.7 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01154  transcriptional regulator MarR family  34.31 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  23.44 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  31 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  40.79 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>