More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2653 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2653  DNA ligase (NAD(+))  100 
 
 		 648 aa  1335    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.869287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2336  DNA ligase (NAD(+))  64.9 
 
 		 649 aa  875    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182524  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2078  DNA ligase (NAD(+))  40.36 
 
 		 615 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2695  DNA ligase (NAD(+))  38.31 
 
 		 652 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.278401  normal  0.204857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1230  DNA ligase, NAD-dependent, putative  35.95 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1227  DNA ligase, NAD-dependent  29.61 
 
 		 656 aa  223  8e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2541  NAD-dependent DNA ligase LigA  30.15 
 
 		 662 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00953923  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2645  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.18 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2245  NAD-dependent DNA ligase LigA  29.82 
 
 		 662 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1371  DNA ligase, NAD-dependent  29.31 
 
 		 648 aa  220  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00123694  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  30.32 
 
 		 662 aa  216  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  26.61 
 
 		 699 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.83 
 
 		 648 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  27.05 
 
 		 692 aa  213  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  28.81 
 
 		 673 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  27.81 
 
 		 672 aa  204  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  28.99 
 
 		 672 aa  203  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  27.05 
 
 		 668 aa  202  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.81 
 
 		 669 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  28.59 
 
 		 715 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  29.24 
 
 		 673 aa  200  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  28.19 
 
 		 673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  28.34 
 
 		 673 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  27.93 
 
 		 714 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.52 
 
 		 669 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.06 
 
 		 697 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.84 
 
 		 669 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.52 
 
 		 669 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 669 aa  196  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 669 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 669 aa  196  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 669 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0981  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.08 
 
 		 666 aa  196  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  27.52 
 
 		 681 aa  196  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  28.21 
 
 		 680 aa  196  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 669 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  28.12 
 
 		 675 aa  195  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  27.06 
 
 		 685 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.37 
 
 		 669 aa  194  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  27.29 
 
 		 714 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.22 
 
 		 669 aa  194  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  26.89 
 
 		 670 aa  193  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  26.5 
 
 		 712 aa  193  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.93 
 
 		 700 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  27.13 
 
 		 684 aa  193  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  27.38 
 
 		 714 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.46 
 
 		 680 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.59 
 
 		 693 aa  190  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  27.08 
 
 		 686 aa  190  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  26 
 
 		 662 aa  190  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  26.8 
 
 		 683 aa  190  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  27.63 
 
 		 673 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  26.41 
 
 		 678 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  26.63 
 
 		 691 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  25.69 
 
 		 694 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  28.51 
 
 		 708 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  25.66 
 
 		 675 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0320  NAD dependent DNA ligase  26.13 
 
 		 691 aa  188  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  28.12 
 
 		 670 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  25.93 
 
 		 667 aa  187  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  26.62 
 
 		 716 aa  186  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2023  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.13 
 
 		 647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000845936  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  27 
 
 		 684 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  26.11 
 
 		 691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  27.16 
 
 		 670 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  27.74 
 
 		 685 aa  185  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  27.27 
 
 		 666 aa  183  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.78 
 
 		 669 aa  183  9.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  27.8 
 
 		 669 aa  183  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.1 
 
 		 670 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  28.32 
 
 		 671 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1480  DNA ligase, NAD-dependent  25.63 
 
 		 663 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  25.45 
 
 		 671 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  26.59 
 
 		 668 aa  182  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  26.91 
 
 		 681 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.26 
 
 		 669 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.65 
 
 		 670 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.14 
 
 		 679 aa  181  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  27.04 
 
 		 677 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0301  DNA ligase, NAD-dependent  27.2 
 
 		 676 aa  181  4.999999999999999e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.10932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  27.82 
 
 		 666 aa  181  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.93 
 
 		 652 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1017  NAD-dependent DNA ligase LigA  26.45 
 
 		 645 aa  180  5.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.682519  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0702  NAD-dependent DNA ligase  27.08 
 
 		 677 aa  180  7e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  25.72 
 
 		 664 aa  180  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  26.57 
 
 		 667 aa  180  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  26.57 
 
 		 667 aa  180  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  26.55 
 
 		 671 aa  180  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  26.02 
 
 		 705 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  26.42 
 
 		 672 aa  179  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1420  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.37 
 
 		 719 aa  179  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1376  NAD-dependent DNA ligase LigA  25.37 
 
 		 719 aa  179  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  27.81 
 
 		 673 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  26.3 
 
 		 673 aa  179  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  25.57 
 
 		 706 aa  178  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0696  DNA ligase, NAD-dependent  27.52 
 
 		 684 aa  178  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.05 
 
 		 670 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  27.52 
 
 		 690 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  27.81 
 
 		 663 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  28.05 
 
 		 670 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>