More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1480 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1480  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 663 aa  1345    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44.98 
 
 		 670 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  46.18 
 
 		 672 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  45.13 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  44.78 
 
 		 668 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  44.98 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 684 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 672 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 668 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.92 
 
 		 671 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.92 
 
 		 671 aa  554  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.92 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.92 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.62 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.92 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.62 
 
 		 671 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  42.92 
 
 		 671 aa  554  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.14 
 
 		 670 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2093  DNA ligase, NAD-dependent  43.65 
 
 		 705 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259807  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.62 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.14 
 
 		 670 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.62 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.92 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0473  DNA ligase, NAD-dependent  44.78 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.71 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 671 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.14 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.62 
 
 		 671 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  43.32 
 
 		 681 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  43.98 
 
 		 673 aa  548  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  43.54 
 
 		 673 aa  545  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  42.99 
 
 		 690 aa  548  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.56 
 
 		 671 aa  546  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  41.85 
 
 		 677 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.29 
 
 		 673 aa  548  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 690 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  42.2 
 
 		 690 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  42.75 
 
 		 691 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.28 
 
 		 670 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  43.74 
 
 		 683 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  42.3 
 
 		 707 aa  544  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.28 
 
 		 669 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  42.17 
 
 		 715 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  41.85 
 
 		 689 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.2 
 
 		 669 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 663 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  42.08 
 
 		 668 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.69 
 
 		 669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 678 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 662 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.39 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.39 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  42.09 
 
 		 675 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.15 
 
 		 711 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  43.25 
 
 		 675 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.39 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  41.65 
 
 		 685 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.15 
 
 		 673 aa  535  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  43.28 
 
 		 670 aa  538  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.54 
 
 		 669 aa  538  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.39 
 
 		 669 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  41.59 
 
 		 670 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 		 673 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  42.88 
 
 		 678 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.39 
 
 		 669 aa  535  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.25 
 
 		 669 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.25 
 
 		 669 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  41.35 
 
 		 685 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.25 
 
 		 669 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  43.64 
 
 		 674 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  42.53 
 
 		 714 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  42.64 
 
 		 669 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  41.43 
 
 		 685 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  42.84 
 
 		 673 aa  533  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  41.07 
 
 		 682 aa  530  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0320  NAD dependent DNA ligase  42.51 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.250656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  41.2 
 
 		 685 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.85 
 
 		 697 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  41.68 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0351  DNA ligase, NAD-dependent  42.69 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  42 
 
 		 669 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.22 
 
 		 684 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  41.89 
 
 		 685 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  42.41 
 
 		 670 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.7 
 
 		 681 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  40.83 
 
 		 694 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  42.55 
 
 		 663 aa  525  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.73 
 
 		 681 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  42.17 
 
 		 714 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0451  DNA ligase, NAD-dependent  41.05 
 
 		 808 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.950618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  43.07 
 
 		 688 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  41.15 
 
 		 673 aa  527  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  40.98 
 
 		 721 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.41 
 
 		 682 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  42.08 
 
 		 670 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  42.44 
 
 		 670 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  42.17 
 
 		 670 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.53 
 
 		 670 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  42.88 
 
 		 688 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>