More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0981 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0981  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 666 aa  1353    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2541  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.92 
 
 		 662 aa  660    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00953923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2245  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.77 
 
 		 662 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  39.67 
 
 		 683 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  40 
 
 		 666 aa  485  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  40 
 
 		 662 aa  478  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  41.96 
 
 		 663 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  41.11 
 
 		 663 aa  477  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  40.45 
 
 		 673 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  39.91 
 
 		 659 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  39.43 
 
 		 671 aa  475  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  39.7 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.7 
 
 		 690 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  39.7 
 
 		 691 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  38.7 
 
 		 670 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  39.85 
 
 		 689 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  40.06 
 
 		 691 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.09 
 
 		 669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 670 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 673 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  38.51 
 
 		 685 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  40.36 
 
 		 673 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  40.21 
 
 		 673 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  38.93 
 
 		 670 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  38.34 
 
 		 680 aa  463  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  39.11 
 
 		 688 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  39.11 
 
 		 688 aa  464  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  39.3 
 
 		 677 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  39.56 
 
 		 674 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  38.42 
 
 		 666 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  37.59 
 
 		 673 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  37.76 
 
 		 672 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  38.77 
 
 		 670 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  40.69 
 
 		 673 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  37.99 
 
 		 672 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 669 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.97 
 
 		 670 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  38.58 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  36.65 
 
 		 703 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  39.79 
 
 		 690 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  39.14 
 
 		 662 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.61 
 
 		 669 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.61 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  38.93 
 
 		 688 aa  459  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  38.99 
 
 		 670 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  38.88 
 
 		 681 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  38.3 
 
 		 685 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  38.69 
 
 		 673 aa  455  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  38.65 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  38.65 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.5 
 
 		 670 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  38.88 
 
 		 674 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  39.23 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  39.14 
 
 		 671 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.21 
 
 		 697 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  39.23 
 
 		 667 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  38.73 
 
 		 674 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  39.28 
 
 		 671 aa  452  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  38.35 
 
 		 685 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  37.59 
 
 		 688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.07 
 
 		 670 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  37.7 
 
 		 694 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.07 
 
 		 670 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  37.26 
 
 		 690 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  36.93 
 
 		 685 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  38.05 
 
 		 672 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  37.87 
 
 		 683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.07 
 
 		 670 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  37.06 
 
 		 694 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  39 
 
 		 669 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  38.22 
 
 		 672 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  36.04 
 
 		 668 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  38.86 
 
 		 665 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  37.87 
 
 		 691 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  38.36 
 
 		 683 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  36.66 
 
 		 678 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  38.51 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  38.11 
 
 		 675 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  38.32 
 
 		 746 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  38.02 
 
 		 691 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.93 
 
 		 686 aa  444  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  38.33 
 
 		 670 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  38.32 
 
 		 691 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  35.76 
 
 		 673 aa  442  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.7 
 
 		 700 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  37.89 
 
 		 678 aa  445  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.05 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  38.17 
 
 		 691 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  38.02 
 
 		 691 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  36.79 
 
 		 668 aa  440  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  37.93 
 
 		 670 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  35.98 
 
 		 681 aa  441  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.06 
 
 		 648 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>