More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1779 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 592 aa  1189    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  49.91 
 
 		 588 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  44.42 
 
 		 590 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.57 
 
 		 616 aa  223  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 574 aa  189  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  34.08 
 
 		 608 aa  134  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  32.18 
 
 		 653 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  32.18 
 
 		 677 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  33.72 
 
 		 680 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  31.96 
 
 		 808 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  28.88 
 
 		 655 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  32.07 
 
 		 763 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 		 679 aa  107  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 		 763 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.34 
 
 		 672 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  30.73 
 
 		 772 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  32.41 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  43.51 
 
 		 830 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 		 649 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  27.79 
 
 		 654 aa  104  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  28.7 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  31.12 
 
 		 691 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  30.55 
 
 		 664 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 		 661 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  30.26 
 
 		 691 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  30.29 
 
 		 747 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  30.27 
 
 		 685 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  31.61 
 
 		 788 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  30.11 
 
 		 768 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 730 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 730 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 673 aa  93.6  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  30.99 
 
 		 804 aa  93.6  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  26.77 
 
 		 642 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  27.49 
 
 		 593 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  29.1 
 
 		 651 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  30.03 
 
 		 671 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  29.97 
 
 		 726 aa  91.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  36.16 
 
 		 731 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  29.18 
 
 		 682 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  29.63 
 
 		 709 aa  92  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 800 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  27.19 
 
 		 593 aa  90.9  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 		 729 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 716 aa  90.9  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 833 aa  90.1  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  29.83 
 
 		 735 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  30.42 
 
 		 798 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  29.68 
 
 		 747 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  28.72 
 
 		 657 aa  88.2  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 		 749 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  30.06 
 
 		 637 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  40 
 
 		 187 aa  87.8  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  29.28 
 
 		 680 aa  87  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  25.88 
 
 		 642 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  40.29 
 
 		 677 aa  87  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  27.44 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.04 
 
 		 603 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  38.93 
 
 		 690 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  27.44 
 
 		 642 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  45.11 
 
 		 677 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  29.24 
 
 		 643 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  41.73 
 
 		 700 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  41.26 
 
 		 647 aa  84.3  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 776 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  26.87 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  29.39 
 
 		 650 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 735 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  28.96 
 
 		 653 aa  84  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 		 712 aa  84  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  37.28 
 
 		 748 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.58 
 
 		 669 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.95 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  27.48 
 
 		 652 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  30.9 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  31.48 
 
 		 747 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  28.82 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  28.86 
 
 		 642 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.9 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 		 774 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  35.19 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  31.97 
 
 		 661 aa  82  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  27.48 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.03 
 
 		 641 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  35.67 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  36.84 
 
 		 654 aa  80.5  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 641 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  41.92 
 
 		 690 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  29.53 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  41.91 
 
 		 663 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  27.71 
 
 		 644 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  41.79 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  30.22 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  35.75 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  33.49 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  30.22 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  29.61 
 
 		 721 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>