65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0025 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 358 aa  736    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  52.22 
 
 		 365 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  51.37 
 
 		 566 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  29.28 
 
 		 626 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  30.56 
 
 		 1221 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.71 
 
 		 717 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  29.91 
 
 		 703 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  24.13 
 
 		 651 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  28.01 
 
 		 1194 aa  90.5  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  23.81 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  26.77 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  22.54 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  23.59 
 
 		 748 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  27.16 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  25.52 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  25.16 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  24.23 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  25 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  26.52 
 
 		 1004 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  28.46 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  23.81 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  28.05 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1167 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  25.36 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  21.97 
 
 		 930 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  22.38 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  25.43 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  22.97 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 		 709 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  19.94 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  27.06 
 
 		 630 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  21.57 
 
 		 2305 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  23.74 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  24.21 
 
 		 1302 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 489 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  28.68 
 
 		 768 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.36 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  25.29 
 
 		 900 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.57 
 
 		 673 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  25.2 
 
 		 610 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  30.77 
 
 		 573 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  21.39 
 
 		 526 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  21.45 
 
 		 2310 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  21.2 
 
 		 456 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  21.59 
 
 		 480 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  23.16 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  20.34 
 
 		 580 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  21.54 
 
 		 481 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  20.13 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  25.55 
 
 		 601 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 493 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  21.2 
 
 		 597 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  21.68 
 
 		 1115 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  22.61 
 
 		 847 aa  46.2  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  21.66 
 
 		 658 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 		 501 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  23.43 
 
 		 705 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  20.98 
 
 		 660 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  20.13 
 
 		 619 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  19.12 
 
 		 590 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>