111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3104 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  71.5 
 
 		 205 aa  270  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  71.5 
 
 		 205 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  48.82 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  45.83 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  42.74 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  34.16 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  34.3 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  45.9 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  46.15 
 
 		 109 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  43.08 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  37.14 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  42.19 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  42.11 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  40.62 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  48.15 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  44.05 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  35.19 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  35 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4199  signal transduction protein  30.77 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.68 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  35.96 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.96 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.63 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3135  calcium-binding EF-hand  31.93 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.850385  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  45.65 
 
 		 135 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  41.38 
 
 		 117 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.5 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  34.04 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  48.33 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  33.77 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0655  signal transduction protein  42.11 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0175  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.5 
 
 		 147 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288154  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  47.06 
 
 		 109 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  43.06 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  43.94 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.77 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  48.15 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  36.19 
 
 		 153 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  45.31 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0677  hypothetical protein  41.3 
 
 		 131 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.730333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  50 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  40.32 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  43.86 
 
 		 142 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  51.02 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  31.07 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  38.2 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  36.23 
 
 		 366 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14031  hypothetical protein  39.22 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  39.73 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  39.73 
 
 		 134 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  37.33 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02173  calcium-dependent mitochondrial carrier protein, putative (Eurofung)  33.67 
 
 		 580 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  38.71 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  42.86 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  43.1 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  32.91 
 
 		 99 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  30.5 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.02 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  32.86 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  32.86 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.69 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_004310  BR1336  acid-shock protein, putative  31.67 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  32.5 
 
 		 479 aa  45.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1296  putative acid-shock protein  31.67 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  38.16 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  31.43 
 
 		 132 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  36.14 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21006  predicted protein  24.29 
 
 		 466 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40998  calmodulin  26.87 
 
 		 154 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17199  2-phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 517 aa  44.7  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.493472  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4746  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3421  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  35 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  29.46 
 
 		 522 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3600  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.91 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.799604  normal  0.113193 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3938  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.91 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  36.23 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4096  hypothetical protein  39.29 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  35.94 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0043  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  40.82 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  41.38 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  28.21 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  27.54 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  23.3 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  34.94 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0821  calcium-binding EF-hand-containing protein  37.29 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  35.19 
 
 		 87 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  44.44 
 
 		 387 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  39.66 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01720  calcium-binding EF-hand protein  31.4 
 
 		 92 aa  43.5  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  44.44 
 
 		 387 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2384  hypothetical protein  31.78 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  30.14 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  31.51 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45986  predicted protein  26.95 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12351  hypothetical protein  36.49 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>