More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1649 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 233 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  73.39 
 
 		 233 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  73.39 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  75.68 
 
 		 239 aa  340  9e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  69.96 
 
 		 233 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  68.24 
 
 		 233 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  31.85 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  46.55 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.81 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.5 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.92 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 187 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 141 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>