197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0823 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  100 
 
 		 798 aa  1581    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  27.35 
 
 		 771 aa  258  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.78 
 
 		 782 aa  239  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.53 
 
 		 886 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  20.61 
 
 		 893 aa  90.9  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.14 
 
 		 883 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.66 
 
 		 882 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.38 
 
 		 887 aa  84.7  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  22.52 
 
 		 899 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.81 
 
 		 895 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.14 
 
 		 883 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  27.94 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  20.67 
 
 		 862 aa  77  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  19.66 
 
 		 972 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.28 
 
 		 1226 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  20.55 
 
 		 901 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  23.56 
 
 		 800 aa  72.4  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.72 
 
 		 1045 aa  71.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.71 
 
 		 967 aa  70.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  20 
 
 		 890 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  31.52 
 
 		 1131 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.41 
 
 		 1011 aa  70.1  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  22.5 
 
 		 906 aa  68.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  23.53 
 
 		 892 aa  68.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  27.59 
 
 		 861 aa  68.6  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  21.13 
 
 		 872 aa  67.8  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  32.61 
 
 		 779 aa  67  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  27.61 
 
 		 895 aa  67.4  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  19.63 
 
 		 884 aa  66.6  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  25.86 
 
 		 1128 aa  66.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  23.51 
 
 		 910 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  19.83 
 
 		 868 aa  65.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.82 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  17.63 
 
 		 784 aa  65.1  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.37 
 
 		 1359 aa  64.7  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.03 
 
 		 882 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  20.43 
 
 		 694 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.16 
 
 		 920 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  23.64 
 
 		 898 aa  62.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  23.45 
 
 		 839 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  19.77 
 
 		 882 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  19.77 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  19.49 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  20.05 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  19.1 
 
 		 908 aa  61.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  21.66 
 
 		 805 aa  61.2  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  25.28 
 
 		 889 aa  60.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  20 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.11 
 
 		 764 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  28.38 
 
 		 1204 aa  59.3  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  20.32 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  20.15 
 
 		 773 aa  58.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  20.28 
 
 		 1225 aa  58.5  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  19.66 
 
 		 849 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  29.8 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  25.31 
 
 		 905 aa  57  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  19.67 
 
 		 877 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  19.63 
 
 		 882 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  25.32 
 
 		 692 aa  57  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.27 
 
 		 755 aa  57.4  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  24.35 
 
 		 842 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  22.76 
 
 		 862 aa  56.2  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  24.29 
 
 		 855 aa  56.6  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  25.73 
 
 		 874 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  31.85 
 
 		 689 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  26.5 
 
 		 1109 aa  56.2  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  24.89 
 
 		 862 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.03 
 
 		 1109 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  19.84 
 
 		 887 aa  55.5  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.42 
 
 		 747 aa  55.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  21.83 
 
 		 868 aa  54.7  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  26.5 
 
 		 1109 aa  54.7  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  25 
 
 		 768 aa  54.7  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  26.4 
 
 		 845 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  18.97 
 
 		 1274 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  18.87 
 
 		 385 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  25.49 
 
 		 769 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.36 
 
 		 811 aa  53.9  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.43 
 
 		 1291 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  24.31 
 
 		 923 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  25.74 
 
 		 771 aa  53.5  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  24.14 
 
 		 731 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.05 
 
 		 837 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  23.66 
 
 		 748 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  24.24 
 
 		 789 aa  52  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.13 
 
 		 717 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  28.37 
 
 		 879 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  23.49 
 
 		 1013 aa  52  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  19.47 
 
 		 845 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  23.87 
 
 		 784 aa  52  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  24.31 
 
 		 832 aa  52  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  18.3 
 
 		 870 aa  51.6  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  25.95 
 
 		 799 aa  51.2  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  25.87 
 
 		 780 aa  50.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.68 
 
 		 385 aa  50.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  22.65 
 
 		 777 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.6 
 
 		 723 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.62 
 
 		 792 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  21.24 
 
 		 829 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  23.25 
 
 		 674 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>