More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02433 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  100 
 
 		 171 aa  350  8e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  66.47 
 
 		 179 aa  234  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  65.68 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  66.27 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  65.09 
 
 		 178 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  65.09 
 
 		 178 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  65.09 
 
 		 178 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  64.74 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  65.06 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  64.16 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  63.74 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  62.72 
 
 		 204 aa  224  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  62.57 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  64.67 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  61.99 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  60.23 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  63.58 
 
 		 179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  61.08 
 
 		 177 aa  217  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  60.23 
 
 		 177 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  60.82 
 
 		 177 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  60 
 
 		 174 aa  207  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  58.08 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  58.68 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  58.68 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  58.08 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  57.65 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  59.04 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  61.08 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  55.03 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  56.89 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  56.89 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  58.62 
 
 		 186 aa  189  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  54.82 
 
 		 177 aa  187  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  54.17 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  58.48 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  49.4 
 
 		 177 aa  180  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  56.29 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  52.7 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  47.95 
 
 		 207 aa  149  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  43.56 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  38.06 
 
 		 181 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  43.21 
 
 		 176 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  37.91 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  40.24 
 
 		 209 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  38.96 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  41.55 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  41.92 
 
 		 178 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  36.54 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  41.55 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  36.36 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  34.78 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  41.51 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  35.95 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  39.74 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  35.29 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  42.67 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  34.64 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.64 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  40.26 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  36.03 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  39.22 
 
 		 170 aa  104  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  41.89 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38 
 
 		 168 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.33 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.33 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.33 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  39.35 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  39.35 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  36.94 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  41.22 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  39.35 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.94 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  40.65 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  41.22 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  39.62 
 
 		 230 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>