More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0671 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  100 
 
 		 768 aa  1574    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  93.75 
 
 		 768 aa  1491    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  44.61 
 
 		 747 aa  612  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  43.2 
 
 		 765 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  41.11 
 
 		 738 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  41.11 
 
 		 738 aa  548  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  41.44 
 
 		 777 aa  515  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  40.93 
 
 		 772 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  39.42 
 
 		 777 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  38.01 
 
 		 792 aa  438  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 753 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 766 aa  392  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 799 aa  366  1e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 814 aa  327  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 835 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 780 aa  231  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 796 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 762 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 815 aa  159  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 782 aa  157  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 786 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 772 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 781 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  25.3 
 
 		 760 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 747 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  24.77 
 
 		 760 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 791 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 729 aa  129  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.14 
 
 		 740 aa  123  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 798 aa  122  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 768 aa  118  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 768 aa  118  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 792 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  24.61 
 
 		 734 aa  114  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 828 aa  111  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 742 aa  107  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  23.37 
 
 		 730 aa  98.6  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 790 aa  97.8  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 841 aa  95.9  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 782 aa  95.5  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 808 aa  93.2  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 736 aa  82  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 786 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 711 aa  80.1  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  25.4 
 
 		 740 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1198  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 754 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1483  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 754 aa  79  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.57 
 
 		 766 aa  79  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 756 aa  77.8  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2341  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 764 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 873 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  21.3 
 
 		 781 aa  67.8  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 694 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  23.02 
 
 		 741 aa  67  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 705 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 873 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.1 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 721 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  24.01 
 
 		 831 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 732 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 792 aa  62  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 701 aa  62  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 794 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 826 aa  61.6  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  24.52 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.01 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.01 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 721 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 709 aa  60.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2298  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.951085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25 
 
 		 743 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 726 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  26.94 
 
 		 766 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1941  TonB-dependent receptor  21.76 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 677 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 733 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  25.84 
 
 		 710 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  26.72 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 714 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 707 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  23.24 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 795 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 755 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2608  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 824 aa  57.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>