125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3069 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 825 aa  1650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  97.32 
 
 		 819 aa  1553    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  69.88 
 
 		 818 aa  1045    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  42.95 
 
 		 909 aa  626  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.17 
 
 		 1009 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  47.72 
 
 		 914 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  46.82 
 
 		 927 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  42.18 
 
 		 1099 aa  336  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  36.69 
 
 		 924 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  39.64 
 
 		 1115 aa  313  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  38.55 
 
 		 1093 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  38.55 
 
 		 1093 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  35.8 
 
 		 1040 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  32.17 
 
 		 1049 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  36.5 
 
 		 864 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.75 
 
 		 1055 aa  205  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.1 
 
 		 1357 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  32.31 
 
 		 947 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.19 
 
 		 1741 aa  173  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  31.4 
 
 		 356 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 		 1594 aa  152  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1763 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  32.57 
 
 		 1762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 		 1762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  32.13 
 
 		 1748 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  32.82 
 
 		 1753 aa  148  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 		 358 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  30.14 
 
 		 989 aa  147  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.58 
 
 		 1023 aa  143  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.75 
 
 		 1770 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 1770 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.72 
 
 		 950 aa  142  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.57 
 
 		 1067 aa  141  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  28.75 
 
 		 358 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  28.75 
 
 		 389 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  28.6 
 
 		 3420 aa  139  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 1349 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.59 
 
 		 2057 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 358 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  28.42 
 
 		 1327 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  28.42 
 
 		 1327 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  28.39 
 
 		 3415 aa  135  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  28.07 
 
 		 1070 aa  131  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  28.24 
 
 		 1070 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.3 
 
 		 1277 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  28.72 
 
 		 1579 aa  125  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.84 
 
 		 1234 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1165 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1165 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.47 
 
 		 868 aa  121  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  29.78 
 
 		 3322 aa  121  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.41 
 
 		 2926 aa  120  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  27.38 
 
 		 1806 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  28.48 
 
 		 1012 aa  118  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.59 
 
 		 1327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  27.33 
 
 		 466 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.55 
 
 		 1197 aa  114  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  26.88 
 
 		 4391 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.97 
 
 		 995 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 		 4312 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  27.17 
 
 		 2637 aa  107  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 		 1571 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  27.06 
 
 		 1971 aa  105  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  26.82 
 
 		 773 aa  104  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 1108 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.65 
 
 		 806 aa  95.1  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.23 
 
 		 1039 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  24.42 
 
 		 1068 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 		 1113 aa  91.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  29.69 
 
 		 820 aa  91.3  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  22.67 
 
 		 1102 aa  87.4  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.25 
 
 		 1234 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  27.42 
 
 		 1250 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  26.05 
 
 		 1234 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  27.05 
 
 		 1234 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  28.21 
 
 		 1626 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  27.91 
 
 		 1254 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  26.95 
 
 		 1252 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  27.58 
 
 		 948 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  26.97 
 
 		 1861 aa  81.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  27.2 
 
 		 949 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  27.13 
 
 		 948 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  27.63 
 
 		 2578 aa  79  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  27.63 
 
 		 2906 aa  78.2  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  26.36 
 
 		 948 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.36 
 
 		 1602 aa  75.5  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 1269 aa  75.1  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.89 
 
 		 1086 aa  74.3  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  26.42 
 
 		 1259 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  26.42 
 
 		 1268 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  26.42 
 
 		 1259 aa  73.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  26.18 
 
 		 1254 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  26.18 
 
 		 1285 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  30.24 
 
 		 861 aa  71.6  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  30 
 
 		 1004 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  30.1 
 
 		 997 aa  70.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  40 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  40 
 
 		 955 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 729 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  38.98 
 
 		 1028 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>