278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44888 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44888  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1107    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2162  MATE efflux family protein  29.15 
 
 		 453 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4839  MATE efflux family protein  26.17 
 
 		 449 aa  92  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4943  MATE efflux family protein  30.98 
 
 		 448 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3426  MATE efflux family protein  30.34 
 
 		 434 aa  90.9  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35587  hypothetical protein  26.43 
 
 		 561 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713211  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55128  hypothetical protein  27.05 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3091  multi anti extrusion protein MatE  25.17 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4176  MATE efflux family protein  27.83 
 
 		 460 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3554  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9349  MATE efflux family protein  27.97 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23253  multi antimicrobial extrusion family protein  24.1 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2891  multidrug efflux pump  26.76 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3351  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.442644  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31014  MOP(MATE) family transporter: multidrug efflux  31.71 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00547148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14620  putative efflux protein, MATE family  26.58 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.220591  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37760  putative efflux protein, MATE family  29.89 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1233  Na+-driven multidrug efflux pump  28.34 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0659218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  36.67 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1452  MATE efflux family protein  26.04 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0177  MATE efflux family protein  25.25 
 
 		 442 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1069  MATE efflux family protein  24.39 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00266  multidrug efflux pump  24.15 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  23.68 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002151  DNA-damage-inducible protein F  23.1 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.539092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3880  MATE efflux family protein  27.14 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000073056 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0074  MATE efflux family protein  26.52 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1334  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 442 aa  67  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433574  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  29.1 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  25.67 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1106  MATE efflux family protein  27.16 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02790  putative efflux protein, MATE family  26.87 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1279  DNA-damage-inducible protein F  25.66 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.244391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1551  MATE efflux family protein  24.1 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.959023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5830  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  39.73 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0110  MATE efflux family protein  20.96 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.372068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4234  MATE efflux family protein  23.6 
 
 		 447 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1376  MATE efflux family protein  25.18 
 
 		 442 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.136301 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.43 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4009  MATE efflux family protein  25.17 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  22.32 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0035  DNA-damage-inducible protein F  24.22 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0845  MATE efflux family protein  26.43 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457545  normal  0.657757 
 
 
-
 
NC_002950  PG0636  MATE efflux family protein  26.36 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  24.58 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4595  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2521  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  23.98 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0025  MATE efflux family protein  22.67 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00700816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  25.36 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  39.02 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3802  MATE efflux family protein  26.15 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3875  MATE efflux family protein  26.5 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4036  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192033  normal  0.230529 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  23.95 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  22.7 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0247  MATE efflux family protein  22.14 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4106  MATE efflux family protein  25.83 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  20.43 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  30.93 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21540  putative efflux protein, MATE family  29.45 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1719  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0706811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  22 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  20.95 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  23.19 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  25 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 453 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  25.61 
 
 		 460 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1840  MATE efflux family protein  25 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308247  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  23.19 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3689  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 470 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  24.29 
 
 		 461 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  24.57 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0439  MATE efflux family protein  23.56 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  30.91 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0180  MATE efflux family protein  23.61 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2965  MATE efflux family protein  24.81 
 
 		 446 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  23.19 
 
 		 546 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0912  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 449 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4459  DNA-damage-inducible SOS response protein  26.84 
 
 		 454 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0886  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  23.89 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  26.69 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4617  DNA-damage-inducible protein F  25.89 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 451 aa  55.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.06 
 
 		 460 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  23.21 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.53 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  23.91 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2108  hypothetical protein  22.83 
 
 		 546 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.24671e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>