More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  23.76 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  24.31 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1648  hypothetical protein  21.08 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  39.24 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2272  TetR family transcriptional regulator  19.66 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 286 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.17 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  28.96 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3069  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0746648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2667  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000274018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 270 aa  52  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.55 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 241 aa  51.6  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 207 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  34.94 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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