More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09151 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  100 
 
 		 760 aa  1538    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  41.79 
 
 		 796 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0360  RNA binding S1:cold shock protein  43.85 
 
 		 765 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.2133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10421  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  43.85 
 
 		 769 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.931628  hitchhiker  0.000483277 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  39.1 
 
 		 784 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1314  RNA binding S1  36.83 
 
 		 773 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.207227 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10211  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  34.87 
 
 		 753 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09231  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  34.45 
 
 		 740 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.124086  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10221  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  34.17 
 
 		 740 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222405  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0953  RNA binding S1  34.83 
 
 		 739 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0549  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.08 
 
 		 783 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4503  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.76 
 
 		 764 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.790425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1800  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.58 
 
 		 784 aa  312  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3422  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.91 
 
 		 750 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.5 
 
 		 750 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.5 
 
 		 750 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  28.97 
 
 		 766 aa  279  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1911  cold shock protein  28.63 
 
 		 745 aa  274  6e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.725568 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  24.67 
 
 		 762 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  22.79 
 
 		 886 aa  154  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  22.79 
 
 		 812 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  22.79 
 
 		 896 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  22.79 
 
 		 838 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  22.79 
 
 		 838 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  22.79 
 
 		 838 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  22.79 
 
 		 896 aa  153  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  22.81 
 
 		 827 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  23.96 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  22.81 
 
 		 827 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  22.81 
 
 		 827 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  23.02 
 
 		 818 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  25.4 
 
 		 701 aa  145  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  22.29 
 
 		 763 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  22.71 
 
 		 817 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  23.98 
 
 		 770 aa  142  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  24.34 
 
 		 751 aa  142  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  22.62 
 
 		 759 aa  140  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  23.94 
 
 		 751 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  22.33 
 
 		 763 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  22.34 
 
 		 722 aa  135  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  23.9 
 
 		 709 aa  135  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  21 
 
 		 828 aa  134  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  22.53 
 
 		 792 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  21.84 
 
 		 876 aa  131  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  22.35 
 
 		 937 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  23.74 
 
 		 716 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  22.56 
 
 		 826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  23.49 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  22.54 
 
 		 880 aa  128  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  22.73 
 
 		 833 aa  127  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  22.57 
 
 		 706 aa  127  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  21.95 
 
 		 777 aa  125  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  22.56 
 
 		 812 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  22.56 
 
 		 812 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  24.01 
 
 		 903 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  22.38 
 
 		 812 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  22.59 
 
 		 814 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  22.03 
 
 		 808 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  21.89 
 
 		 808 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  22.16 
 
 		 806 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  22.02 
 
 		 808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  22.02 
 
 		 808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  22.02 
 
 		 804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  22.02 
 
 		 808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1271  ribonuclease R  22.82 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  22.02 
 
 		 810 aa  119  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  22.02 
 
 		 806 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  23.2 
 
 		 834 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  21.89 
 
 		 808 aa  117  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  22.25 
 
 		 833 aa  117  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  20.87 
 
 		 720 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  22.02 
 
 		 806 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  23.06 
 
 		 801 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  24.02 
 
 		 722 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  23.01 
 
 		 788 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  21.91 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  21.19 
 
 		 809 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2988  ribonuclease R  22.07 
 
 		 771 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216479 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0682  ribonuclease R  22.89 
 
 		 794 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.43674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  20.74 
 
 		 807 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  20.74 
 
 		 807 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  20.74 
 
 		 807 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  20.74 
 
 		 807 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  22.54 
 
 		 830 aa  111  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  20.63 
 
 		 807 aa  111  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  21.12 
 
 		 834 aa  107  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  24.75 
 
 		 828 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  22.15 
 
 		 821 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  22.93 
 
 		 792 aa  103  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  25.07 
 
 		 895 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  21.55 
 
 		 751 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  24.57 
 
 		 817 aa  103  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  24.57 
 
 		 817 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  20.98 
 
 		 842 aa  102  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  22.97 
 
 		 766 aa  99.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  20.92 
 
 		 819 aa  98.6  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4617  ribonuclease R  21.05 
 
 		 826 aa  98.6  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  24.68 
 
 		 833 aa  98.2  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  25 
 
 		 833 aa  97.8  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  24.85 
 
 		 805 aa  96.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>