More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4503 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  52.98 
 
 		 750 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0549  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  54.12 
 
 		 783 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4503  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  100 
 
 		 764 aa  1549    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.790425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3422  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  52.05 
 
 		 750 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1911  cold shock protein  48.79 
 
 		 745 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.725568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  52.98 
 
 		 750 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1800  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  53.32 
 
 		 784 aa  780    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  54.06 
 
 		 766 aa  794    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  30.76 
 
 		 760 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.54 
 
 		 759 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  30.13 
 
 		 762 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  31.91 
 
 		 784 aa  313  6.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  31.05 
 
 		 706 aa  312  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  30.61 
 
 		 758 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  29.96 
 
 		 903 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  30.76 
 
 		 796 aa  311  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  30.18 
 
 		 716 aa  308  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1314  RNA binding S1  31.38 
 
 		 773 aa  307  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.207227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  30.38 
 
 		 763 aa  307  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  28.73 
 
 		 788 aa  306  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  29.64 
 
 		 763 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  29.96 
 
 		 870 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  28.17 
 
 		 751 aa  303  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  28.03 
 
 		 751 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  31.47 
 
 		 706 aa  301  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  28.61 
 
 		 792 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  28.49 
 
 		 806 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  31.87 
 
 		 770 aa  299  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  30.51 
 
 		 777 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  28.63 
 
 		 806 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  28.49 
 
 		 804 aa  297  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  28.49 
 
 		 810 aa  297  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  28.49 
 
 		 806 aa  297  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  28.35 
 
 		 808 aa  297  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  28.49 
 
 		 808 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  28.49 
 
 		 808 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  28.25 
 
 		 814 aa  297  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  30.39 
 
 		 876 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  28.94 
 
 		 757 aa  296  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  29.36 
 
 		 709 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  28.35 
 
 		 812 aa  295  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  31.03 
 
 		 752 aa  293  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.35 
 
 		 805 aa  293  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  29.9 
 
 		 705 aa  292  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  30.74 
 
 		 848 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  31.18 
 
 		 715 aa  290  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  30.69 
 
 		 864 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0360  RNA binding S1:cold shock protein  28.61 
 
 		 765 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.2133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  29.67 
 
 		 828 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10221  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  27.69 
 
 		 740 aa  287  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  29.84 
 
 		 871 aa  286  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  29.18 
 
 		 720 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  29.53 
 
 		 827 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  29.87 
 
 		 895 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  29.53 
 
 		 827 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  29.53 
 
 		 827 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10211  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  27.55 
 
 		 753 aa  283  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  29.69 
 
 		 886 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  28.31 
 
 		 790 aa  283  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  29.69 
 
 		 812 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  28.31 
 
 		 790 aa  283  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  29.69 
 
 		 838 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  29.69 
 
 		 838 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  29.55 
 
 		 840 aa  283  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  29.69 
 
 		 838 aa  283  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  30.67 
 
 		 857 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  29.69 
 
 		 896 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0953  RNA binding S1  28.03 
 
 		 739 aa  282  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  29.69 
 
 		 896 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  30.81 
 
 		 857 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  31.86 
 
 		 1182 aa  280  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  30.67 
 
 		 857 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  27.64 
 
 		 792 aa  279  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  29.4 
 
 		 817 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  30.42 
 
 		 859 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  28.9 
 
 		 828 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  30.17 
 
 		 737 aa  278  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  28.55 
 
 		 937 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  30.03 
 
 		 737 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  30.63 
 
 		 861 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  30.53 
 
 		 736 aa  277  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  29.04 
 
 		 801 aa  277  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  30.67 
 
 		 749 aa  277  5e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  30.15 
 
 		 906 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  29.55 
 
 		 818 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  30.21 
 
 		 907 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  27.57 
 
 		 708 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  28.82 
 
 		 817 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  28.82 
 
 		 817 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09231  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  26.59 
 
 		 740 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.124086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  29.71 
 
 		 733 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  29.35 
 
 		 766 aa  271  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.07 
 
 		 735 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  29.9 
 
 		 710 aa  270  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  28.38 
 
 		 795 aa  270  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.27 
 
 		 794 aa  270  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  26.35 
 
 		 709 aa  270  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  28.45 
 
 		 833 aa  270  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  29.07 
 
 		 876 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  28.45 
 
 		 833 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>