More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1314 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  59.18 
 
 		 796 aa  902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  65.89 
 
 		 784 aa  999    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1314  RNA binding S1  100 
 
 		 773 aa  1553    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.207227 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0360  RNA binding S1:cold shock protein  38.7 
 
 		 765 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.2133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10421  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  38.62 
 
 		 769 aa  568  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.931628  hitchhiker  0.000483277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  36.83 
 
 		 760 aa  547  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10211  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  33.33 
 
 		 753 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10221  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  33.47 
 
 		 740 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222405  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09231  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  32.89 
 
 		 740 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.124086  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0953  RNA binding S1  32.49 
 
 		 739 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  33.16 
 
 		 750 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  33.16 
 
 		 750 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1911  cold shock protein  33.5 
 
 		 745 aa  321  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.725568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3422  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  31.92 
 
 		 750 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4503  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  31.76 
 
 		 764 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.790425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0549  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.01 
 
 		 783 aa  313  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1800  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.52 
 
 		 784 aa  302  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  31.15 
 
 		 766 aa  289  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  24.21 
 
 		 706 aa  170  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  23.73 
 
 		 763 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  23.24 
 
 		 937 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  23.35 
 
 		 861 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  22.15 
 
 		 763 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  23.34 
 
 		 759 aa  152  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  23.65 
 
 		 857 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  22.85 
 
 		 877 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  22.82 
 
 		 877 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  23.54 
 
 		 857 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  23.41 
 
 		 857 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  22.18 
 
 		 828 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  23.11 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  23.89 
 
 		 720 aa  146  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  23.42 
 
 		 705 aa  145  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  22.27 
 
 		 859 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  25.14 
 
 		 777 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  22.69 
 
 		 876 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  23.66 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  22.19 
 
 		 886 aa  138  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  22.02 
 
 		 709 aa  138  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  21.96 
 
 		 896 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  21.96 
 
 		 896 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  21.96 
 
 		 812 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  21.96 
 
 		 838 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  21.96 
 
 		 838 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  21.96 
 
 		 838 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  23.83 
 
 		 752 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  21.8 
 
 		 895 aa  137  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  23.48 
 
 		 903 aa  137  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  23.94 
 
 		 871 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  23.65 
 
 		 1055 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  23.37 
 
 		 870 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  22.25 
 
 		 818 aa  135  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  23.48 
 
 		 758 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  23.61 
 
 		 833 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  22.28 
 
 		 829 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  21.62 
 
 		 827 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  21.62 
 
 		 827 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  21.75 
 
 		 827 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  22.54 
 
 		 817 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  21.58 
 
 		 810 aa  134  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  23.14 
 
 		 803 aa  134  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  23.14 
 
 		 826 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  21.24 
 
 		 828 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  22.92 
 
 		 755 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2598  ribonuclease R  23.87 
 
 		 869 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000938061  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  22.27 
 
 		 746 aa  132  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  22.27 
 
 		 746 aa  132  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  23.75 
 
 		 819 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  21.74 
 
 		 694 aa  130  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  22.89 
 
 		 876 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  21.72 
 
 		 817 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  21.72 
 
 		 817 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  22.22 
 
 		 907 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  22.89 
 
 		 716 aa  127  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  21.96 
 
 		 906 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  22.12 
 
 		 830 aa  127  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  25.29 
 
 		 1037 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1240  ribonuclease R  24.79 
 
 		 764 aa  126  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  21.54 
 
 		 770 aa  125  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  22.56 
 
 		 833 aa  125  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2568  ribonuclease R  24.79 
 
 		 764 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0166651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  22.7 
 
 		 886 aa  124  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  21.97 
 
 		 788 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  22.46 
 
 		 736 aa  124  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  22.29 
 
 		 833 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  22.22 
 
 		 801 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  22.46 
 
 		 749 aa  124  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  23.21 
 
 		 808 aa  122  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  21.63 
 
 		 758 aa  122  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  21.18 
 
 		 818 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  21.47 
 
 		 737 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  21.34 
 
 		 737 aa  118  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  22.76 
 
 		 710 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  22.76 
 
 		 710 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  22.24 
 
 		 771 aa  117  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  22.24 
 
 		 770 aa  118  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  23.67 
 
 		 817 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  21.28 
 
 		 834 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  22.41 
 
 		 833 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  22.25 
 
 		 842 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>