More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14471 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  100 
 
 		 796 aa  1623    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  60 
 
 		 784 aa  891    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1314  RNA binding S1  58.73 
 
 		 773 aa  877    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.207227 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0360  RNA binding S1:cold shock protein  40.86 
 
 		 765 aa  632  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.2133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  41.79 
 
 		 760 aa  621  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10421  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  40.93 
 
 		 769 aa  622  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.931628  hitchhiker  0.000483277 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10221  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  34.79 
 
 		 740 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222405  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10211  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  34.26 
 
 		 753 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09231  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  33.47 
 
 		 740 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.124086  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0953  RNA binding S1  34.67 
 
 		 739 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3422  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.19 
 
 		 750 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1911  cold shock protein  33.29 
 
 		 745 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.725568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0549  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.32 
 
 		 783 aa  323  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.95 
 
 		 750 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.95 
 
 		 750 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4503  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.71 
 
 		 764 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.790425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1800  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.66 
 
 		 784 aa  307  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  30.47 
 
 		 766 aa  290  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  24.39 
 
 		 937 aa  177  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  23.77 
 
 		 857 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  23.84 
 
 		 877 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  22.89 
 
 		 861 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  23.68 
 
 		 859 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  22.89 
 
 		 857 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  23.84 
 
 		 763 aa  157  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  22.61 
 
 		 857 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  22.93 
 
 		 877 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  22.65 
 
 		 876 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  24.22 
 
 		 763 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  22.36 
 
 		 828 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  23.19 
 
 		 829 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  23.74 
 
 		 886 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  22.73 
 
 		 762 aa  147  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  23.74 
 
 		 812 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  23.74 
 
 		 838 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  23.74 
 
 		 838 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  23.74 
 
 		 838 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  24.11 
 
 		 758 aa  146  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  23.98 
 
 		 805 aa  146  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  23.74 
 
 		 896 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  23.74 
 
 		 896 aa  146  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  22.64 
 
 		 907 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  22.33 
 
 		 906 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  23.2 
 
 		 722 aa  145  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  23.24 
 
 		 827 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  23.24 
 
 		 827 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  23.24 
 
 		 827 aa  144  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  23.34 
 
 		 828 aa  144  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  22.96 
 
 		 895 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  23.93 
 
 		 870 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  23.68 
 
 		 706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  24.31 
 
 		 876 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  23.99 
 
 		 1055 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  25.46 
 
 		 706 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  23.08 
 
 		 759 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  24.76 
 
 		 705 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  23.45 
 
 		 817 aa  141  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  23.45 
 
 		 817 aa  141  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  22.05 
 
 		 808 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  22.86 
 
 		 817 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  21.99 
 
 		 792 aa  140  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  21.92 
 
 		 810 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  22.8 
 
 		 818 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  22.13 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  21.92 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  24.36 
 
 		 715 aa  139  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  21.92 
 
 		 808 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  21.92 
 
 		 808 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  21.92 
 
 		 804 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  24.28 
 
 		 709 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  21.78 
 
 		 806 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  21.5 
 
 		 812 aa  138  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  21.96 
 
 		 806 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  24.57 
 
 		 833 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  23.68 
 
 		 777 aa  137  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  22.93 
 
 		 833 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1240  ribonuclease R  24.18 
 
 		 764 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  23.48 
 
 		 758 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  22.81 
 
 		 810 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  22.52 
 
 		 833 aa  134  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2568  ribonuclease R  24.18 
 
 		 764 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0166651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  24.93 
 
 		 770 aa  134  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  23.86 
 
 		 758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  23.31 
 
 		 735 aa  132  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  22.22 
 
 		 803 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  22.54 
 
 		 815 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  22.08 
 
 		 880 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  21.88 
 
 		 766 aa  129  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  22.83 
 
 		 750 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  23.78 
 
 		 755 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  23.57 
 
 		 871 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  22.45 
 
 		 737 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  23.38 
 
 		 737 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  21.73 
 
 		 751 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  22.43 
 
 		 801 aa  127  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  21.86 
 
 		 751 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  23.75 
 
 		 826 aa  127  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  23.04 
 
 		 720 aa  127  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  21.39 
 
 		 818 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  23.93 
 
 		 819 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>