More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0549 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  56.25 
 
 		 750 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3422  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  56.99 
 
 		 750 aa  846    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4503  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  54.12 
 
 		 764 aa  780    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.790425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0549  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  100 
 
 		 783 aa  1593    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1911  cold shock protein  49.4 
 
 		 745 aa  669    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.725568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  57.22 
 
 		 766 aa  856    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  56.25 
 
 		 750 aa  816    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1800  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  81.02 
 
 		 784 aa  1306    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  31.73 
 
 		 706 aa  343  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  32 
 
 		 770 aa  336  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  30.67 
 
 		 758 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.68 
 
 		 759 aa  333  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  32.53 
 
 		 784 aa  330  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  31.31 
 
 		 705 aa  326  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  31.32 
 
 		 796 aa  323  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29.81 
 
 		 762 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  29.16 
 
 		 814 aa  317  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  31.11 
 
 		 751 aa  317  7e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  29.72 
 
 		 806 aa  317  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  30.34 
 
 		 763 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  29.72 
 
 		 808 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  29.62 
 
 		 804 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  29.48 
 
 		 808 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  29.72 
 
 		 808 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  29.35 
 
 		 806 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  29.08 
 
 		 760 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.97 
 
 		 751 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  28.98 
 
 		 763 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  30.54 
 
 		 716 aa  315  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  29.35 
 
 		 810 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  29.54 
 
 		 788 aa  315  2.9999999999999996e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  29.21 
 
 		 806 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  28.98 
 
 		 709 aa  313  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  28.79 
 
 		 812 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  30.88 
 
 		 715 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  28.51 
 
 		 792 aa  307  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  29.33 
 
 		 790 aa  300  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  29.33 
 
 		 790 aa  300  8e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  30.63 
 
 		 777 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1314  RNA binding S1  31.11 
 
 		 773 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.207227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  28.98 
 
 		 757 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  28.88 
 
 		 857 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  28.61 
 
 		 857 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  29.93 
 
 		 1182 aa  296  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  28.74 
 
 		 857 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  30.2 
 
 		 710 aa  296  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  30.9 
 
 		 752 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  29.04 
 
 		 792 aa  295  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  30.42 
 
 		 903 aa  295  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  28.08 
 
 		 801 aa  294  4e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  30.83 
 
 		 706 aa  294  4e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  29.93 
 
 		 710 aa  293  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  28.48 
 
 		 859 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  29.09 
 
 		 876 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  29.85 
 
 		 848 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  30.89 
 
 		 716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  27.3 
 
 		 828 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  29.25 
 
 		 871 aa  288  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10211  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  26.18 
 
 		 753 aa  287  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10221  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  26.05 
 
 		 740 aa  287  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222405  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0953  RNA binding S1  26.74 
 
 		 739 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  30.08 
 
 		 864 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  27.11 
 
 		 709 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  27.94 
 
 		 817 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  29.26 
 
 		 766 aa  283  8.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  28.65 
 
 		 870 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  29.41 
 
 		 720 aa  282  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  28.29 
 
 		 895 aa  282  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  27.4 
 
 		 937 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  28.02 
 
 		 827 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  28.13 
 
 		 827 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  28.13 
 
 		 827 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  28.22 
 
 		 801 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  27.16 
 
 		 818 aa  280  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  27.91 
 
 		 812 aa  280  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30.69 
 
 		 863 aa  279  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  27.72 
 
 		 896 aa  279  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  27.63 
 
 		 828 aa  279  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  27.91 
 
 		 838 aa  279  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  27.91 
 
 		 838 aa  279  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  27.91 
 
 		 838 aa  279  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  27.79 
 
 		 886 aa  279  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  27.72 
 
 		 896 aa  279  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  27.77 
 
 		 833 aa  278  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  27.58 
 
 		 813 aa  278  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  27.72 
 
 		 749 aa  276  8e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  27.31 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  27.44 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.44 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  27.58 
 
 		 736 aa  276  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  27.44 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  27.44 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  27.8 
 
 		 876 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  27.44 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  27.44 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  27.44 
 
 		 813 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  29.62 
 
 		 722 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  28.26 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  28.26 
 
 		 817 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  27.73 
 
 		 812 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>