282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10421 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_10421  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  100 
 
 		 769 aa  1557    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.931628  hitchhiker  0.000483277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0360  RNA binding S1:cold shock protein  94.67 
 
 		 765 aa  1446    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.2133  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14471  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  40.93 
 
 		 796 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09151  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  43.85 
 
 		 760 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000238472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1314  RNA binding S1  38.1 
 
 		 773 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.207227 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1161  RNA binding S1  37.73 
 
 		 784 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.140399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10211  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  38.03 
 
 		 753 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10221  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  38.03 
 
 		 740 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.222405  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09231  putative acetazolamide conferring resistance protein Zam  37.7 
 
 		 740 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.124086  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0953  RNA binding S1  38.08 
 
 		 739 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4503  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.23 
 
 		 764 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.790425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1800  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.17 
 
 		 784 aa  276  8e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3422  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.92 
 
 		 750 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1911  cold shock protein  27.32 
 
 		 745 aa  273  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.725568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0549  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  27.67 
 
 		 783 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1545  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.1 
 
 		 750 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.405162  normal  0.0471328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1518  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.1 
 
 		 750 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  26.56 
 
 		 766 aa  244  6e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  22.3 
 
 		 705 aa  144  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  21.67 
 
 		 722 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  21.07 
 
 		 759 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  22 
 
 		 752 aa  134  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  21.44 
 
 		 746 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  21.44 
 
 		 746 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  22.77 
 
 		 706 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  21.28 
 
 		 762 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  21.02 
 
 		 777 aa  124  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  20.84 
 
 		 763 aa  121  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  22.24 
 
 		 895 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  21.59 
 
 		 848 aa  120  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  20 
 
 		 715 aa  120  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  21.19 
 
 		 812 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  21.19 
 
 		 896 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  21.19 
 
 		 838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  21.19 
 
 		 838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  21.19 
 
 		 886 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  21.19 
 
 		 838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  21.19 
 
 		 896 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  20.42 
 
 		 720 aa  119  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  21.57 
 
 		 864 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  21.42 
 
 		 706 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  21.83 
 
 		 758 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  20.68 
 
 		 763 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  21.11 
 
 		 937 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  21.41 
 
 		 871 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  24.08 
 
 		 722 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  20.44 
 
 		 755 aa  114  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  22.11 
 
 		 716 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  22.71 
 
 		 863 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  22.82 
 
 		 735 aa  112  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  19.57 
 
 		 737 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  21.45 
 
 		 709 aa  112  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  19.21 
 
 		 829 aa  111  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  20.75 
 
 		 818 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  22.77 
 
 		 701 aa  107  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  20.29 
 
 		 792 aa  106  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  20.54 
 
 		 828 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  20.45 
 
 		 788 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  20.75 
 
 		 779 aa  104  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  20.46 
 
 		 751 aa  104  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  19.43 
 
 		 737 aa  104  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  18.79 
 
 		 861 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  20.32 
 
 		 751 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  19.83 
 
 		 906 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  20.31 
 
 		 812 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  20.31 
 
 		 903 aa  102  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  20.18 
 
 		 806 aa  102  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  18.61 
 
 		 818 aa  102  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  19.58 
 
 		 907 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  20.05 
 
 		 808 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  20.05 
 
 		 808 aa  101  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  19.39 
 
 		 877 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  20.05 
 
 		 804 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  20.05 
 
 		 810 aa  100  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  20.05 
 
 		 808 aa  100  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  20.05 
 
 		 806 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  20.93 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  20.79 
 
 		 710 aa  100  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  19.79 
 
 		 814 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  19.84 
 
 		 806 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  19.92 
 
 		 804 aa  97.8  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  21.22 
 
 		 801 aa  96.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  19.19 
 
 		 877 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  19.55 
 
 		 709 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  19.58 
 
 		 822 aa  96.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  21.02 
 
 		 813 aa  95.1  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  21.45 
 
 		 770 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  20.28 
 
 		 810 aa  92.4  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  19.37 
 
 		 817 aa  92.4  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  21.25 
 
 		 795 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  19.9 
 
 		 827 aa  91.3  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  20.48 
 
 		 749 aa  91.3  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  20.05 
 
 		 803 aa  91.3  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  20.48 
 
 		 736 aa  90.9  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  21.97 
 
 		 704 aa  90.1  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0576  ribonuclease R  20.41 
 
 		 749 aa  90.1  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0737  ribonuclease R  18.8 
 
 		 852 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.428134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  19.55 
 
 		 774 aa  87.8  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  19.28 
 
 		 834 aa  87.4  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  20.6 
 
 		 766 aa  87  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>