69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2515 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  100 
 
 		 917 aa  1845    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  23.31 
 
 		 781 aa  94.4  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  24.49 
 
 		 797 aa  93.2  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  23.43 
 
 		 781 aa  92  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.31 
 
 		 798 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  30.88 
 
 		 798 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  20.76 
 
 		 777 aa  77  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  30.82 
 
 		 790 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  21.79 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  22.41 
 
 		 774 aa  74.7  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  21.74 
 
 		 785 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  27.48 
 
 		 801 aa  72.4  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  34.16 
 
 		 773 aa  71.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.02 
 
 		 785 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  34.87 
 
 		 798 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  34.44 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  32.68 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 753 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 753 aa  68.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  31.37 
 
 		 775 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 753 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  31.33 
 
 		 762 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  31.65 
 
 		 761 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  30.46 
 
 		 790 aa  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.56 
 
 		 670 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  30.06 
 
 		 852 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  29.8 
 
 		 654 aa  62.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  31.33 
 
 		 766 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  32.89 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  32 
 
 		 779 aa  61.6  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  31.58 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  31.58 
 
 		 758 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  32.24 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.92 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  28.49 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  31.88 
 
 		 755 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  31.88 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  31.88 
 
 		 745 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  29.8 
 
 		 754 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  31.88 
 
 		 755 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  28.85 
 
 		 712 aa  57  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  28.48 
 
 		 669 aa  57  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  24.8 
 
 		 757 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  28.51 
 
 		 588 aa  55.8  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  29.8 
 
 		 855 aa  55.5  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  29.8 
 
 		 855 aa  54.7  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  22.45 
 
 		 723 aa  54.7  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  25 
 
 		 766 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  25 
 
 		 766 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  25 
 
 		 766 aa  53.5  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  30.43 
 
 		 431 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  23.93 
 
 		 756 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  30.43 
 
 		 495 aa  53.5  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  27.56 
 
 		 766 aa  53.5  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  27.81 
 
 		 754 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  27.6 
 
 		 739 aa  52.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  36.78 
 
 		 766 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  36.78 
 
 		 766 aa  51.6  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  28 
 
 		 750 aa  51.6  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  26.83 
 
 		 722 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  30.43 
 
 		 849 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  28.02 
 
 		 773 aa  48.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  29.03 
 
 		 791 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  24.93 
 
 		 790 aa  47.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  33.33 
 
 		 806 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  28.83 
 
 		 614 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.71 
 
 		 930 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  27.27 
 
 		 841 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26944  predicted protein  30.38 
 
 		 788 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.168097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>