266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1428 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1428  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 413 aa  824    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0032  hypothetical protein  36.21 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.72548  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  24.12 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 1421 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.73 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 1737 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 878 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.25 
 
 		 988 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.54 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 3560 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.86 
 
 		 1056 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.99 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.15 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1276 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  24.15 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 870 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1517  hypothetical protein  40.86 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0196221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.28 
 
 		 738 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 927 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.29 
 
 		 632 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 750 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.2 
 
 		 1979 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 		 357 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 574 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 707 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  38.52 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 594 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.31 
 
 		 706 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  33.11 
 
 		 584 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 762 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 828 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  33.1 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 784 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 776 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.07 
 
 		 1694 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.49 
 
 		 818 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 592 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 280 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  27.27 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  23.46 
 
 		 252 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.62 
 
 		 795 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 715 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 311 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 655 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 3035 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 836 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.37 
 
 		 573 aa  53.5  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.47 
 
 		 887 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 4079 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  34.69 
 
 		 817 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1138 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 4489 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 363 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.71 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 1192 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 217 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 		 1022 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  42.17 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 923 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 645 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 740 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.59 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32 
 
 		 577 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 366 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 686 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 790 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 562 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 773 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 708 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.9 
 
 		 745 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 563 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 626 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 729 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 614 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 286 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 626 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 263 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  30.43 
 
 		 572 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 614 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.91 
 
 		 293 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 162 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 614 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.34 
 
 		 784 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 614 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.26 
 
 		 743 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 662 aa  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.07 
 
 		 2240 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 635 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 618 aa  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 635 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>