222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0235 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  57.86 
 
 		 584 aa  662    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  58.04 
 
 		 575 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  100 
 
 		 572 aa  1182    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  54.82 
 
 		 580 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  54.45 
 
 		 582 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  53.25 
 
 		 572 aa  592  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  42.4 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  39.27 
 
 		 584 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  29.32 
 
 		 404 aa  127  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  26.55 
 
 		 403 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  26.51 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  26.39 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  25.33 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  26.03 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.6 
 
 		 403 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  27.75 
 
 		 406 aa  97.1  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  25.67 
 
 		 404 aa  95.1  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  26.8 
 
 		 403 aa  94.4  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  28.06 
 
 		 756 aa  87.4  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  30 
 
 		 745 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  25.87 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  29.03 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  29.03 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  27.06 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  26.41 
 
 		 769 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  27.06 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  26.41 
 
 		 716 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  27.06 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  27.06 
 
 		 844 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  27.06 
 
 		 766 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  28.34 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  29.44 
 
 		 745 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  29.6 
 
 		 769 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  25.72 
 
 		 749 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  26.74 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  24.93 
 
 		 750 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  26.56 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  25.51 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  36.75 
 
 		 746 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  26.85 
 
 		 404 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  27.62 
 
 		 757 aa  72  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  25.6 
 
 		 752 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  28.11 
 
 		 752 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  25.19 
 
 		 426 aa  67  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  28.96 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  28.41 
 
 		 736 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  23.85 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3592  protein of unknown function DUF181  26.28 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0680194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 279 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  32.2 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.88 
 
 		 1056 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  28.57 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  28.1 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1756  hypothetical protein  26.8 
 
 		 728 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  26.67 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39610  hypothetical protein  26.95 
 
 		 616 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.94 
 
 		 818 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2932  hypothetical protein  26.89 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000159994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3664  hypothetical protein  26.62 
 
 		 729 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 988 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1265  hypothetical protein  28.63 
 
 		 584 aa  56.6  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0824  hypothetical protein  26.21 
 
 		 728 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0307116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0738  hypothetical protein  26.06 
 
 		 728 aa  56.6  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0643  hypothetical protein  26.06 
 
 		 729 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  25.65 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  26.97 
 
 		 732 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3599  protein of unknown function DUF181  26.06 
 
 		 729 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3569  hypothetical protein  26 
 
 		 727 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  31.3 
 
 		 628 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  26.91 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  26.89 
 
 		 585 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1425  hypothetical protein  28.7 
 
 		 586 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.824732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3214  hypothetical protein  27.27 
 
 		 734 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.668386  normal  0.254813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3211  hypothetical protein  25.56 
 
 		 728 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.357431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3928  hypothetical protein  25 
 
 		 728 aa  54.7  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 878 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2297  hypothetical protein  27.18 
 
 		 728 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  36.26 
 
 		 243 aa  54.7  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3787  hypothetical protein  25.73 
 
 		 729 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.859391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0612  hypothetical protein  26.67 
 
 		 582 aa  54.7  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.166851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.99 
 
 		 810 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1066  hypothetical protein  29.77 
 
 		 586 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2216  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.522723  normal  0.321049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2113  hypothetical protein  27.63 
 
 		 728 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20686  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00909  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2738  protein of unknown function DUF181  29.17 
 
 		 586 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2423  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  53.9  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2691  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.864502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1011  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000298438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28020  hypothetical protein  26.6 
 
 		 734 aa  53.9  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.458293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00916  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3199  hypothetical protein  26.3 
 
 		 728 aa  53.9  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 4079 aa  53.9  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  25.79 
 
 		 405 aa  53.9  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1002  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.332512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1073  hypothetical protein  29.77 
 
 		 597 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788303  normal  0.409514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1039  hypothetical protein  29.77 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.548133  normal  0.203105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 301 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>