More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0032 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0032  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.72548  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1428  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
413 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 
878 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
1737 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.04 
 
 
810 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
686 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
3172 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.62 
 
 
887 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
1421 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
1276 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
3301 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.87 
 
 
725 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
1450 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.56 
 
 
561 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
685 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 
818 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
762 aa  67.4  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
311 aa  67  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.96 
 
 
730 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
739 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.56 
 
 
561 aa  66.6  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 
689 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
792 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
681 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
927 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.55 
 
 
620 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
632 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 
1056 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 
1694 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
909 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
562 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
714 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
637 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 
784 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
715 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.04 
 
 
795 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 
1486 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
566 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 
448 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 
988 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
3035 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
3145 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.57 
 
 
1056 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.93 
 
 
865 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
828 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
827 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
620 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.47 
 
 
1022 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.63 
 
 
1067 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.37 
 
 
1979 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
847 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
697 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
1085 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
697 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.95 
 
 
267 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
323 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
399 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.32 
 
 
681 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2561  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 
547 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.36 
 
 
816 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.37 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
612 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25.6 
 
 
560 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  27.08 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
1827 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
280 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
828 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
808 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  20.73 
 
 
832 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  28.99 
 
 
1677 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
688 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  20.99 
 
 
682 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  26.06 
 
 
676 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
629 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
566 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
466 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  29.05 
 
 
240 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
1406 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.63 
 
 
764 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
2240 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.6 
 
 
837 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.03 
 
 
626 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
828 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.35 
 
 
629 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.08 
 
 
708 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
306 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
593 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
4079 aa  57  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.86 
 
 
979 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
543 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
744 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
465 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
718 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  20.54 
 
 
661 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>