282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0973 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 208 aa  411  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 192 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  37.8 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 333 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 307 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4946  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  42.68 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 186 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2703  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00115407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 141 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 318 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 318 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  31.01 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 318 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 318 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  26.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 317 aa  45.1  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 187 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.42 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>