More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0585 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0585  PAS fold-3 domain protein  100 
 
 
236 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
830 aa  105  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 
1589 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  37.17 
 
 
632 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.19 
 
 
768 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.05 
 
 
1072 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
882 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
732 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
1291 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
946 aa  72.4  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  33.9 
 
 
1076 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.47 
 
 
419 aa  72  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.04 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0144  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  33.88 
 
 
711 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.37 
 
 
1094 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
932 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1771 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  34.75 
 
 
1116 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
765 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5968  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 
622 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.155545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
1139 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1122 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
1121 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 
658 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.03 
 
 
1765 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
1768 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1765 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 
631 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
893 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1767 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1767 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.08 
 
 
1763 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  26.72 
 
 
623 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
1767 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
1138 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.29 
 
 
925 aa  63.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  29.69 
 
 
1141 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  33.02 
 
 
1111 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0443  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 
465 aa  62  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1118 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1118 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1045  hypothetical protein  39.77 
 
 
506 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
764 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.81 
 
 
1120 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1419  hypothetical protein  43.84 
 
 
106 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  30.43 
 
 
1239 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 
1784 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.96 
 
 
833 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  38.3 
 
 
852 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2293  PAS sensor protein  37.63 
 
 
302 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0726187  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1363 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1786 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1782 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1792 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
817 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
1741 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2624  PAS domain-containing protein  33.62 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.100385  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  30.52 
 
 
896 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
955 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3596  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
1132 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
3706 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2999  hypothetical protein  33.08 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91602  decreased coverage  0.000583467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1985  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.53 
 
 
639 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
769 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
975 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
763 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
1044 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 
974 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0356  chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 
652 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
834 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
1419 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.17 
 
 
714 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  39.33 
 
 
956 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.13 
 
 
1078 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
1064 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
802 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
962 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0436  PAS sensor protein  37.5 
 
 
359 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0470  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
359 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  0.146486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2998  hypothetical protein  28.57 
 
 
326 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00400405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
969 aa  55.5  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2345  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.37 
 
 
486 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.78 
 
 
1071 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
799 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  31.58 
 
 
420 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2941  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.46 
 
 
719 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1808 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
1643 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  28.81 
 
 
808 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1559 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0507  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
359 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.0364855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3452  putative PAS/PAC sensor protein  29.23 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413638  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2070  sensory transduction histidine kinase  30.25 
 
 
594 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.04 
 
 
1248 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
837 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
2693 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  28.68 
 
 
509 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
745 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>