More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0443 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0443  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
465 aa  951    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5968  putative PAS/PAC sensor protein  33.17 
 
 
622 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.155545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
769 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  29.86 
 
 
509 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0139  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
1066 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
1178 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
1291 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 
1406 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 
946 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3829  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
475 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.821642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1297  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  34.9 
 
 
926 aa  93.2  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
1741 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
1043 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
732 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.62 
 
 
768 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  27.8 
 
 
1141 aa  88.2  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
1138 aa  87.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
962 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
846 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25 
 
 
3706 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  23.64 
 
 
694 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
764 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.51 
 
 
1078 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
1484 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
1122 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  28.19 
 
 
896 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  26.94 
 
 
1765 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1121 aa  81.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
1118 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
1118 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.75 
 
 
1021 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
1767 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
1792 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
1782 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 
1771 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
1767 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
1784 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
1786 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
1767 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  32.59 
 
 
1589 aa  78.2  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  27.09 
 
 
632 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 
1765 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 
658 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  27.16 
 
 
1111 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1132 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
837 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.32 
 
 
1763 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0144  putative PAS/PAC sensor protein  31.45 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  26.7 
 
 
711 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 
728 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1244  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.06 
 
 
1090 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.258549  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3452  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413638  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 
636 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 
1313 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 
1168 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
1044 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1504  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.51 
 
 
944 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.628866  normal  0.0653987 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  30.43 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0368  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
695 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0590374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  24.74 
 
 
1037 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1215 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  29.94 
 
 
619 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.14 
 
 
783 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
831 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1363 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.44 
 
 
1977 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
1139 aa  70.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
1768 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.63 
 
 
1120 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  23.11 
 
 
1116 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.99 
 
 
1251 aa  70.5  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
969 aa  70.1  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 
1287 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 
551 aa  70.1  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 
655 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.22 
 
 
1072 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2854  putative two component signal transduction protein  22.7 
 
 
917 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 
1965 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.85 
 
 
1071 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
1369 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  24.74 
 
 
1225 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
1002 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4447  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 
1878 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.516196  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
1225 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
1205 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  26.92 
 
 
907 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
841 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.45 
 
 
1101 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
955 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  28.05 
 
 
1268 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
799 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
1428 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
1000 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  25.25 
 
 
1187 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.02 
 
 
1070 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
1419 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  28.95 
 
 
673 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.15 
 
 
1013 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
547 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>