More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0507 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0507  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 359 aa  726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.0364855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0470  signal transduction histidine kinase  90.22 
 
 		 359 aa  621  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  0.146486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0436  PAS sensor protein  90.5 
 
 		 359 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4958  signal transduction histidine kinase  73.71 
 
 		 363 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000385226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4177  signal transduction histidine kinase  61.93 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4442  signal transduction histidine kinase  59.71 
 
 		 342 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.411184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 		 1465 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.48 
 
 		 1535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 647 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 647 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  42.42 
 
 		 1335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1559 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 1383 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 1177 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 576 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 1714 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 527 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.51 
 
 		 1084 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 739 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 1927 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 1015 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 705 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 1113 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 508 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1406 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1108 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 1051 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  45.76 
 
 		 1346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 705 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 932 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.44 
 
 		 833 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0467119  normal  0.0611646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.73 
 
 		 833 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 1267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 1711 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 788 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.62 
 
 		 832 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1059 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 681 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1093 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1093 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  40.16 
 
 		 969 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 713 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1011 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 866 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.91 
 
 		 1418 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.27 
 
 		 1086 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  42.74 
 
 		 1071 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 551 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  41.03 
 
 		 1251 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 912 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1297 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 713 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  37.34 
 
 		 717 aa  102  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 1092 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  30.18 
 
 		 728 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 1021 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 603 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.08 
 
 		 783 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  41.98 
 
 		 1086 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  39.83 
 
 		 1131 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  29.75 
 
 		 744 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 582 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 733 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 1002 aa  99.4  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  35.34 
 
 		 1303 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 728 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 913 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  38.98 
 
 		 1037 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 655 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 896 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  38.61 
 
 		 1096 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.42 
 
 		 754 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 1096 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 1741 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 708 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  34.46 
 
 		 655 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 745 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 655 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 1676 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 816 aa  92.8  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 930 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 809 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 547 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1013 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 738 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 530 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.04 
 
 		 2031 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 635 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 955 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1043 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 524 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1808 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 991 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 872 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  36.22 
 
 		 829 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  30.24 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 1111 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 864 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 1253 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 		 506 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>