More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4177 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4177  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 341 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4442  signal transduction histidine kinase  82.11 
 
 		 342 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.411184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4958  signal transduction histidine kinase  62.46 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000385226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0470  signal transduction histidine kinase  61.63 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  0.146486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0507  signal transduction histidine kinase  61.93 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.0364855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0436  PAS sensor protein  61.63 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 		 1559 aa  129  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.82 
 
 		 1465 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.76 
 
 		 647 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 		 1177 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  45.9 
 
 		 1335 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 551 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  48.31 
 
 		 1346 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.42 
 
 		 1011 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.89 
 
 		 833 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 527 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 647 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.38 
 
 		 1535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 576 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.27 
 
 		 833 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0467119  normal  0.0611646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 705 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 508 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 705 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 1711 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 1267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 		 1059 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 		 1927 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 		 1383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.65 
 
 		 832 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 1015 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 739 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 1714 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 912 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 788 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.61 
 
 		 1084 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 866 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 713 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 1676 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 1113 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 1021 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  38.75 
 
 		 717 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 713 aa  105  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1086 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 932 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1092 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.96 
 
 		 1418 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 1108 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  42.86 
 
 		 1086 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.7 
 
 		 1071 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 681 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  26.67 
 
 		 744 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 1051 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1093 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  41.03 
 
 		 1037 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 1093 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 969 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 1013 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.84 
 
 		 1251 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 582 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  38.02 
 
 		 1131 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 1303 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  31.96 
 
 		 728 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 809 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 728 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 547 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 896 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 816 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 815 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 913 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 655 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 524 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  31.28 
 
 		 624 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 1741 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 488 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 655 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  32.37 
 
 		 449 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1810  PAS sensor protein  38.14 
 
 		 829 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 682 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  25.96 
 
 		 676 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 1124 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 1516 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.92 
 
 		 754 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  31.28 
 
 		 655 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 603 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 955 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1002 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1043 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 		 733 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 572 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 745 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 1253 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 783 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 966 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  27.17 
 
 		 783 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 819 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 892 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  40.68 
 
 		 1096 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 930 aa  87.4  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 850 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>