109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0752 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 439 aa  899    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  37.36 
 
 		 451 aa  292  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  40.05 
 
 		 451 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.16 
 
 		 456 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  33.85 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  33.02 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  35.27 
 
 		 470 aa  244  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  33.58 
 
 		 441 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  34.84 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.54 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.91 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 449 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 487 aa  97.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.18 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 453 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  21.78 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  21.65 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.81 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.33 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1639  extracellular solute-binding protein family 1  34.45 
 
 		 463 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.102178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 427 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  20.48 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3325  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.83 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 465 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 503 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  21.84 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  21.84 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  21.48 
 
 		 465 aa  49.7  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  22.43 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  23.4 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  21.27 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  21.65 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  20.59 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3366  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  20.95 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.48 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0632  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  23.18 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 416 aa  47  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0832  multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.14 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.669088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01220  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.21 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  18.73 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3895  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  20.85 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1463  extracellular solute-binding protein family 1  20.05 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 455 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  24.44 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  20.55 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.58 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>