More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0968 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 324 aa  666    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  44.95 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  45.23 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  45.82 
 
 		 338 aa  295  5e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3616  uroporphyrinogen decarboxylase  42.06 
 
 		 348 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00257093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  39.81 
 
 		 355 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  39.44 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  38.2 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2192  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0550  uroporphyrinogen decarboxylase  37.35 
 
 		 343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2335  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.540822  normal  0.254547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  38.56 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2936  uroporphyrinogen decarboxylase  38.63 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0680  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2066  uroporphyrinogen decarboxylase  38.12 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.502432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0854  uroporphyrinogen decarboxylase  38.12 
 
 		 341 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.913792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  40.44 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  38.23 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  38.15 
 
 		 349 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1986  uroporphyrinogen decarboxylase  37.81 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2528  uroporphyrinogen decarboxylase  39.02 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 		 338 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2973  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 345 aa  235  9e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0977  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.942428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2833  uroporphyrinogen decarboxylase  37.3 
 
 		 344 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2705  uroporphyrinogen decarboxylase  37.27 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  38.32 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  38.2 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 358 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4393  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  38.34 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.024361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5016  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.739471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  36.83 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3934  uroporphyrinogen decarboxylase  36.56 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3569  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4260  uroporphyrinogen decarboxylase  36.56 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962102  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  34.56 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0483  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  34.86 
 
 		 357 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1927  uroporphyrinogen decarboxylase  36.06 
 
 		 353 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.849644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1379  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  34.81 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  33.84 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  32.92 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  34.18 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1268  uroporphyrinogen decarboxylase  36.31 
 
 		 340 aa  205  7e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2695  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 342 aa  205  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  34.84 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  33.95 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  33.94 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  34.74 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  34.74 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  35.96 
 
 		 340 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  36.51 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1271  uroporphyrinogen decarboxylase  34.53 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  36.62 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  33.33 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  35.47 
 
 		 348 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  32.62 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  33.76 
 
 		 354 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1039  uroporphyrinogen decarboxylase  34.04 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  34.46 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  33.76 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  34.19 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  35.42 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1470  uroporphyrinogen decarboxylase  35.56 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  34.85 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  35 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  34.58 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  35.16 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  35.16 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  36.31 
 
 		 354 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  33.02 
 
 		 355 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  37.18 
 
 		 353 aa  195  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  33.44 
 
 		 354 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0529  uroporphyrinogen decarboxylase  34.44 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  33.75 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  34.08 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  32.72 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  33.93 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  33.93 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  34.27 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  33.93 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  33.93 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1456  uroporphyrinogen decarboxylase  35.49 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  34.59 
 
 		 354 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  33.86 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  33.93 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  32.63 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1494  uroporphyrinogen decarboxylase  34.24 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0243578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  32.42 
 
 		 353 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  32.54 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 		 354 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>