236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7911 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7911  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0417125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 264 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 246 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 236 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2778  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 207 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0630256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 271 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0718  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  26.71 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4321  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.675467  normal  0.0583361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 226 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  21.84 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 247 aa  44.7  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 247 aa  44.7  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 218 aa  44.7  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3703  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3776  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>