More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2716 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 433 aa  895    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  54.44 
 
 		 448 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3456  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2511  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  33.26 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.98381  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5582  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.231128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  25.13 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.39 
 
 		 456 aa  97.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0965  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0052659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 447 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0752  putative extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0427  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2263  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0015  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29420  carbohydrate-binding protein  25.08 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.2 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  22.53 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0111  putative glycerol 3-phosphate transport protein, ugpB-like protein  22.54 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.22 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  20.25 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  23.59 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5274  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2948  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.99 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0034  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.7 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.36 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.73 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  20.79 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.84 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.61 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  22.28 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  21.52 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  27.57 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  21.77 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  20.79 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.92 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.37 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 487 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.73 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  21.59 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  22.61 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  21.21 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  21.52 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  19.18 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.05 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  21.43 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0113  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.270734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4664  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2164  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>